Protein–RNA interactions for Protein: Q12751

RTP1, RNA polymerase II assembly factor RTP1, yeastyeast

Predictions only

Length 981 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RTP1Q12751 YLR126CYLR126C 756 nt6.85□□□□□ -1.31
RTP1Q12751 ELA1YNL230C 1140 nt6.85□□□□□ -1.31
RTP1Q12751 ISC1YER019W 1434 nt6.84□□□□□ -1.31
RTP1Q12751 CHL4YDR254W 1377 nt6.84□□□□□ -1.31
RTP1Q12751 STT3YGL022W 2157 nt6.84□□□□□ -1.31
RTP1Q12751 HEM2YGL040C 1029 nt6.84□□□□□ -1.31
RTP1Q12751 GCV3YAL044C 513 nt6.84□□□□□ -1.31
RTP1Q12751 ARG81YML099C 2643 nt6.84□□□□□ -1.31
RTP1Q12751 LCP5YER127W 1074 nt6.83□□□□□ -1.32
RTP1Q12751 YHR145CYHR145C 357 nt6.83□□□□□ -1.32
RTP1Q12751 OGG1YML060W 1131 nt6.83□□□□□ -1.32
RTP1Q12751 YPR160C-AYPR160C-A 285 nt6.83□□□□□ -1.32
RTP1Q12751 HIS7YBR248C 1659 nt6.83□□□□□ -1.32
RTP1Q12751 RSC30YHR056C 2652 nt6.83□□□□□ -1.32
RTP1Q12751 PRY3YJL078C 2646 nt6.82□□□□□ -1.32
RTP1Q12751 PPT1YGR123C 1542 nt6.82□□□□□ -1.32
RTP1Q12751 SEC18YBR080C 2277 nt6.82□□□□□ -1.32
RTP1Q12751 DPB2YPR175W 2070 nt6.82□□□□□ -1.32
RTP1Q12751 MAK31YCR020C-A 267 nt6.82□□□□□ -1.32
RTP1Q12751 ERP2YAL007C 648 nt6.82□□□□□ -1.32
RTP1Q12751 YUR1YJL139C 1287 nt6.82□□□□□ -1.32
RTP1Q12751 TPK1YJL164C 1194 nt6.82□□□□□ -1.32
RTP1Q12751 MDE1YJR024C 735 nt6.82□□□□□ -1.32
RTP1Q12751 KSH1YNL024C-A 219 nt6.82□□□□□ -1.32
RTP1Q12751 MRPS12YNR036C 462 nt6.82□□□□□ -1.32
RTP1Q12751 PZF1YPR186C 1290 nt6.82□□□□□ -1.32
RTP1Q12751 YNL247WYNL247W 2304 nt6.82□□□□□ -1.32
RTP1Q12751 PEX31YGR004W 1389 nt6.82□□□□□ -1.32
RTP1Q12751 ASK1YKL052C 879 nt6.81□□□□□ -1.32
RTP1Q12751 IRC11YOR013W 471 nt6.81□□□□□ -1.32
RTP1Q12751 ECM31YBR176W 939 nt6.81□□□□□ -1.32
RTP1Q12751 CEF1YMR213W 1773 nt6.81□□□□□ -1.32
RTP1Q12751 SIT1YEL065W 1887 nt6.81□□□□□ -1.32
RTP1Q12751 ARO10YDR380W 1908 nt6.8□□□□□ -1.32
RTP1Q12751 DYS1YHR068W 1164 nt6.8□□□□□ -1.32
RTP1Q12751 TKL2YBR117C 2046 nt6.8□□□□□ -1.32
RTP1Q12751 YFL013W-AYFL013W-A 804 nt6.79□□□□□ -1.32
RTP1Q12751 LDB16YCL005W 771 nt6.79□□□□□ -1.32
RTP1Q12751 ASN1YPR145W 1719 nt6.79□□□□□ -1.32
RTP1Q12751 IMA2YOL157C 1770 nt6.78□□□□□ -1.32
RTP1Q12751 YDL085C-AYDL085C-A 207 nt6.78□□□□□ -1.32
RTP1Q12751 PRS2YER099C 957 nt6.78□□□□□ -1.32
RTP1Q12751 RPN11YFR004W 921 nt6.78□□□□□ -1.32
RTP1Q12751 YGL072CYGL072C 360 nt6.78□□□□□ -1.32
RTP1Q12751 JJJ3YJR097W 519 nt6.78□□□□□ -1.32
RTP1Q12751 RPS5YJR123W 678 nt6.78□□□□□ -1.32
RTP1Q12751 MIA40YKL195W 1212 nt6.78□□□□□ -1.32
RTP1Q12751 RPL10YLR075W 666 nt6.78□□□□□ -1.32
RTP1Q12751 CAF40YNL288W 1122 nt6.78□□□□□ -1.32
RTP1Q12751 YPL250W-AYPL250W-A 288 nt6.78□□□□□ -1.32
RTP1Q12751 BPL1YDL141W 2073 nt6.78□□□□□ -1.32
RTP1Q12751 DDC1YPL194W 1839 nt6.78□□□□□ -1.32
RTP1Q12751 RAP1YNL216W 2484 nt6.77□□□□□ -1.32
RTP1Q12751 tG(GCC)BtG(GCC)B 71 nt6.77□□□□□ -1.33
RTP1Q12751 SUF16tG(GCC)C 71 nt6.77□□□□□ -1.33
RTP1Q12751 tG(GCC)D1tG(GCC)D1 71 nt6.77□□□□□ -1.33
RTP1Q12751 tG(GCC)D2tG(GCC)D2 71 nt6.77□□□□□ -1.33
RTP1Q12751 tG(GCC)EtG(GCC)E 71 nt6.77□□□□□ -1.33
RTP1Q12751 SUF20tG(GCC)F1 71 nt6.77□□□□□ -1.33
RTP1Q12751 tG(GCC)F2tG(GCC)F2 71 nt6.77□□□□□ -1.33
RTP1Q12751 tG(GCC)G1tG(GCC)G1 71 nt6.77□□□□□ -1.33
RTP1Q12751 tG(GCC)G2tG(GCC)G2 71 nt6.77□□□□□ -1.33
RTP1Q12751 tG(GCC)J1tG(GCC)J1 71 nt6.77□□□□□ -1.33
RTP1Q12751 SUF23tG(GCC)J2 71 nt6.77□□□□□ -1.33
RTP1Q12751 tG(GCC)MtG(GCC)M 71 nt6.77□□□□□ -1.33
RTP1Q12751 tG(GCC)O1tG(GCC)O1 71 nt6.77□□□□□ -1.33
RTP1Q12751 SUF17tG(GCC)O2 71 nt6.77□□□□□ -1.33
RTP1Q12751 tG(GCC)P1tG(GCC)P1 71 nt6.77□□□□□ -1.33
RTP1Q12751 tG(GCC)P2tG(GCC)P2 71 nt6.77□□□□□ -1.33
RTP1Q12751 ICL1YER065C 1674 nt6.77□□□□□ -1.33
RTP1Q12751 SLX5YDL013W 1860 nt6.77□□□□□ -1.33
RTP1Q12751 HST3YOR025W 1344 nt6.76□□□□□ -1.33
RTP1Q12751 YET3YDL072C 612 nt6.76□□□□□ -1.33
RTP1Q12751 MEH1YKR007W 555 nt6.76□□□□□ -1.33
RTP1Q12751 VMS1YDR049W 1899 nt6.76□□□□□ -1.33
RTP1Q12751 EDE1YBL047C 4146 nt6.76□□□□□ -1.33
RTP1Q12751 MNS1YJR131W 1650 nt6.75□□□□□ -1.33
RTP1Q12751 AIM17YHL021C 1398 nt6.75□□□□□ -1.33
RTP1Q12751 AI5_BETAQ0075 1065 nt6.75□□□□□ -1.33
RTP1Q12751 YJU2YKL095W 837 nt6.75□□□□□ -1.33
RTP1Q12751 NOP7YGR103W 1818 nt6.75□□□□□ -1.33
RTP1Q12751 FRE5YOR384W 2085 nt6.75□□□□□ -1.33
RTP1Q12751 CNM67YNL225C 1746 nt6.74□□□□□ -1.33
RTP1Q12751 RPP1YHR062C 882 nt6.74□□□□□ -1.33
RTP1Q12751 RPS3YNL178W 723 nt6.74□□□□□ -1.33
RTP1Q12751 RIO1YOR119C 1455 nt6.73□□□□□ -1.33
RTP1Q12751 SOH1YGL127C 384 nt6.73□□□□□ -1.33
RTP1Q12751 ECM14YHR132C 1293 nt6.73□□□□□ -1.33
RTP1Q12751 GON7YJL184W 372 nt6.73□□□□□ -1.33
RTP1Q12751 GCN3YKR026C 918 nt6.73□□□□□ -1.33
RTP1Q12751 JNM1YMR294W 1122 nt6.73□□□□□ -1.33
RTP1Q12751 COX5AYNL052W 462 nt6.73□□□□□ -1.33
RTP1Q12751 NOG2YNR053C 1461 nt6.73□□□□□ -1.33
RTP1Q12751 HEM1YDR232W 1647 nt6.72□□□□□ -1.33
RTP1Q12751 HXT2YMR011W 1626 nt6.72□□□□□ -1.33
RTP1Q12751 DFM1YDR411C 1026 nt6.72□□□□□ -1.33
RTP1Q12751 CSM2YIL132C 642 nt6.72□□□□□ -1.33
RTP1Q12751 AVO1YOL078W 3531 nt6.72□□□□□ -1.33
RTP1Q12751 PET112YBL080C 1626 nt6.72□□□□□ -1.33
RTP1Q12751 YBR284WYBR284W 2394 nt6.72□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 88 ms