Protein–RNA interactions for Protein: Q12500

AVL9, Late secretory pathway protein AVL9, yeastyeast

Predictions only

Length 764 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
AVL9Q12500 CEF1YMR213W 1773 nt6.36□□□□□ -1.39
AVL9Q12500 MSS1YMR023C 1581 nt6.35□□□□□ -1.39
AVL9Q12500 TFG2YGR005C 1203 nt6.35□□□□□ -1.39
AVL9Q12500 ECM14YHR132C 1293 nt6.35□□□□□ -1.39
AVL9Q12500 RSC2YLR357W 2670 nt6.34□□□□□ -1.39
AVL9Q12500 ISC1YER019W 1434 nt6.34□□□□□ -1.39
AVL9Q12500 DUS4YLR405W 1104 nt6.34□□□□□ -1.39
AVL9Q12500 RRS1YOR294W 612 nt6.34□□□□□ -1.39
AVL9Q12500 ENP1YBR247C 1452 nt6.34□□□□□ -1.4
AVL9Q12500 TFC6YDR362C 2019 nt6.33□□□□□ -1.4
AVL9Q12500 CMR1YDL156W 1569 nt6.33□□□□□ -1.4
AVL9Q12500 DRE2YKR071C 1047 nt6.33□□□□□ -1.4
AVL9Q12500 YMR119W-AYMR119W-A 375 nt6.33□□□□□ -1.4
AVL9Q12500 IRS4YKR019C 1848 nt6.33□□□□□ -1.4
AVL9Q12500 RRP9YPR137W 1722 nt6.33□□□□□ -1.4
AVL9Q12500 CRF1YDR223W 1404 nt6.33□□□□□ -1.4
AVL9Q12500 YCK1YHR135C 1617 nt6.32□□□□□ -1.4
AVL9Q12500 YDR278CYDR278C 318 nt6.32□□□□□ -1.4
AVL9Q12500 MSP1YGR028W 1089 nt6.32□□□□□ -1.4
AVL9Q12500 YHR070C-AYHR070C-A 411 nt6.32□□□□□ -1.4
AVL9Q12500 YHR145CYHR145C 357 nt6.32□□□□□ -1.4
AVL9Q12500 SCS7YMR272C 1155 nt6.32□□□□□ -1.4
AVL9Q12500 YNL067W-AYNL067W-A 147 nt6.32□□□□□ -1.4
AVL9Q12500 HIS7YBR248C 1659 nt6.32□□□□□ -1.4
AVL9Q12500 YFL052WYFL052W 1398 nt6.31□□□□□ -1.4
AVL9Q12500 MRPL1YDR116C 858 nt6.31□□□□□ -1.4
AVL9Q12500 TOM20YGR082W 552 nt6.31□□□□□ -1.4
AVL9Q12500 YMR295CYMR295C 594 nt6.31□□□□□ -1.4
AVL9Q12500 HVG1YER039C 750 nt6.3□□□□□ -1.4
AVL9Q12500 CIS3YJL158C 684 nt6.3□□□□□ -1.4
AVL9Q12500 YIL055CYIL055C 1884 nt6.3□□□□□ -1.4
AVL9Q12500 IMA5YJL216C 1746 nt6.29□□□□□ -1.4
AVL9Q12500 MSN2YMR037C 2115 nt6.29□□□□□ -1.4
AVL9Q12500 SKI2YLR398C 3864 nt6.29□□□□□ -1.4
AVL9Q12500 ATG23YLR431C 1362 nt6.29□□□□□ -1.4
AVL9Q12500 YBR284WYBR284W 2394 nt6.29□□□□□ -1.4
AVL9Q12500 ERG1YGR175C 1491 nt6.28□□□□□ -1.4
AVL9Q12500 RIO1YOR119C 1455 nt6.28□□□□□ -1.4
AVL9Q12500 TPO3YPR156C 1869 nt6.28□□□□□ -1.4
AVL9Q12500 TEP1YNL128W 1305 nt6.27□□□□□ -1.41
AVL9Q12500 YEL075W-AYEL075W-A 612 nt6.27□□□□□ -1.41
AVL9Q12500 YLR122CYLR122C 378 nt6.27□□□□□ -1.41
AVL9Q12500 YLR463CYLR463C 552 nt6.27□□□□□ -1.41
AVL9Q12500 TSR3YOR006C 942 nt6.27□□□□□ -1.41
AVL9Q12500 GLN1YPR035W 1113 nt6.27□□□□□ -1.41
AVL9Q12500 PET112YBL080C 1626 nt6.27□□□□□ -1.41
AVL9Q12500 YML133CYML133C 4125 nt6.27□□□□□ -1.41
AVL9Q12500 GUD1YDL238C 1470 nt6.27□□□□□ -1.41
AVL9Q12500 WHI2YOR043W 1461 nt6.27□□□□□ -1.41
AVL9Q12500 YHL017WYHL017W 1599 nt6.27□□□□□ -1.41
AVL9Q12500 HST3YOR025W 1344 nt6.26□□□□□ -1.41
AVL9Q12500 PAP2YOL115W 1755 nt6.26□□□□□ -1.41
AVL9Q12500 OPT1YJL212C 2400 nt6.26□□□□□ -1.41
AVL9Q12500 PFK2YMR205C 2880 nt6.26□□□□□ -1.41
AVL9Q12500 MAK31YCR020C-A 267 nt6.26□□□□□ -1.41
AVL9Q12500 YET3YDL072C 612 nt6.26□□□□□ -1.41
AVL9Q12500 REV7YIL139C 738 nt6.26□□□□□ -1.41
AVL9Q12500 LDS1YAL018C 978 nt6.26□□□□□ -1.41
AVL9Q12500 ICT1YLR099C 1185 nt6.26□□□□□ -1.41
AVL9Q12500 YML018CYML018C 1182 nt6.26□□□□□ -1.41
AVL9Q12500 SLD7YOR060C 774 nt6.26□□□□□ -1.41
AVL9Q12500 DAP1YPL170W 459 nt6.26□□□□□ -1.41
AVL9Q12500 ARO7YPR060C 771 nt6.26□□□□□ -1.41
AVL9Q12500 PYC2YBR218C 3543 nt6.26□□□□□ -1.41
AVL9Q12500 DSF1YEL070W 1509 nt6.25□□□□□ -1.41
AVL9Q12500 YNR073CYNR073C 1509 nt6.25□□□□□ -1.41
AVL9Q12500 TRP5YGL026C 2124 nt6.25□□□□□ -1.41
AVL9Q12500 RPT3YDR394W 1287 nt6.25□□□□□ -1.41
AVL9Q12500 YHL018WYHL018W 363 nt6.25□□□□□ -1.41
AVL9Q12500 YHR213W-AYHR213W-A 234 nt6.25□□□□□ -1.41
AVL9Q12500 BCY1YIL033C 1251 nt6.25□□□□□ -1.41
AVL9Q12500 EFM3YJR129C 1020 nt6.25□□□□□ -1.41
AVL9Q12500 YLR184WYLR184W 348 nt6.25□□□□□ -1.41
AVL9Q12500 YML083CYML083C 1257 nt6.25□□□□□ -1.41
AVL9Q12500 ARA2YMR041C 1008 nt6.25□□□□□ -1.41
AVL9Q12500 MRPL10YNL284C 969 nt6.25□□□□□ -1.41
AVL9Q12500 LDB19YOR322C 2457 nt6.25□□□□□ -1.41
AVL9Q12500 MDM31YHR194W 1740 nt6.25□□□□□ -1.41
AVL9Q12500 HXK2YGL253W 1461 nt6.24□□□□□ -1.41
AVL9Q12500 CDC34YDR054C 888 nt6.24□□□□□ -1.41
AVL9Q12500 TSA1YML028W 591 nt6.24□□□□□ -1.41
AVL9Q12500 RNH201YNL072W 924 nt6.24□□□□□ -1.41
AVL9Q12500 RAP1YNL216W 2484 nt6.24□□□□□ -1.41
AVL9Q12500 GAL83YER027C 1254 nt6.23□□□□□ -1.41
AVL9Q12500 AVO2YMR068W 1281 nt6.23□□□□□ -1.41
AVL9Q12500 IME2YJL106W 1938 nt6.23□□□□□ -1.41
AVL9Q12500 PGK1YCR012W 1251 nt6.22□□□□□ -1.41
AVL9Q12500 YDR015CYDR015C 240 nt6.22□□□□□ -1.41
AVL9Q12500 CAF40YNL288W 1122 nt6.22□□□□□ -1.41
AVL9Q12500 FSF1YOR271C 984 nt6.22□□□□□ -1.41
AVL9Q12500 MRPS16YPL013C 366 nt6.22□□□□□ -1.41
AVL9Q12500 UTP4YDR324C 2331 nt6.22□□□□□ -1.41
AVL9Q12500 KKQ8YKL168C 2175 nt6.21□□□□□ -1.41
AVL9Q12500 GPB2YAL056W 2643 nt6.21□□□□□ -1.41
AVL9Q12500 ICL1YER065C 1674 nt6.21□□□□□ -1.42
AVL9Q12500 YIR017W-AYIR017W-A 600 nt6.21□□□□□ -1.42
AVL9Q12500 YOL163WYOL163W 510 nt6.21□□□□□ -1.42
AVL9Q12500 YPR123CYPR123C 435 nt6.21□□□□□ -1.42
AVL9Q12500 PRP24YMR268C 1335 nt6.21□□□□□ -1.42
AVL9Q12500 ASN1YPR145W 1719 nt6.2□□□□□ -1.42
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 13.7 ms