Protein–RNA interactions for Protein: Q12391

TY1A-NL1, Transposon Ty1-NL1 Gag polyprotein, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1A-NL1Q12391 YNG2YHR090C 849 nt6.76□□□□□ -1.33
TY1A-NL1Q12391 SPO16YHR153C 597 nt6.76□□□□□ -1.33
TY1A-NL1Q12391 YNR025CYNR025C 360 nt6.76□□□□□ -1.33
TY1A-NL1Q12391 MDM12YOL009C 816 nt6.76□□□□□ -1.33
TY1A-NL1Q12391 ECM8YBR076W 1065 nt6.76□□□□□ -1.33
TY1A-NL1Q12391 CAN1YEL063C 1773 nt6.76□□□□□ -1.33
TY1A-NL1Q12391 APM3YBR288C 1452 nt6.75□□□□□ -1.33
TY1A-NL1Q12391 AAD6YFL056C 639 nt6.75□□□□□ -1.33
TY1A-NL1Q12391 YFH7YFR007W 1062 nt6.75□□□□□ -1.33
TY1A-NL1Q12391 ELF1YKL160W 438 nt6.75□□□□□ -1.33
TY1A-NL1Q12391 PEX13YLR191W 1161 nt6.75□□□□□ -1.33
TY1A-NL1Q12391 ORM2YLR350W 651 nt6.75□□□□□ -1.33
TY1A-NL1Q12391 SPO20YMR017W 1194 nt6.75□□□□□ -1.33
TY1A-NL1Q12391 YAH1YPL252C 519 nt6.75□□□□□ -1.33
TY1A-NL1Q12391 MMR1YLR190W 1476 nt6.74□□□□□ -1.33
TY1A-NL1Q12391 MTQ2YDR140W 666 nt6.74□□□□□ -1.33
TY1A-NL1Q12391 HSP31YDR533C 714 nt6.74□□□□□ -1.33
TY1A-NL1Q12391 ERG26YGL001C 1050 nt6.74□□□□□ -1.33
TY1A-NL1Q12391 FIP1YJR093C 984 nt6.74□□□□□ -1.33
TY1A-NL1Q12391 YKR051WYKR051W 1257 nt6.74□□□□□ -1.33
TY1A-NL1Q12391 YMR178WYMR178W 825 nt6.74□□□□□ -1.33
TY1A-NL1Q12391 DCI1YOR180C 816 nt6.74□□□□□ -1.33
TY1A-NL1Q12391 snR37snR37 386 nt6.74□□□□□ -1.33
TY1A-NL1Q12391 KCH1YJR054W 1494 nt6.73□□□□□ -1.33
TY1A-NL1Q12391 ADE17YMR120C 1779 nt6.73□□□□□ -1.33
TY1A-NL1Q12391 ATP2YJR121W 1536 nt6.73□□□□□ -1.33
TY1A-NL1Q12391 KAR5YMR065W 1515 nt6.73□□□□□ -1.33
TY1A-NL1Q12391 YDR042CYDR042C 603 nt6.73□□□□□ -1.33
TY1A-NL1Q12391 EFM3YJR129C 1020 nt6.73□□□□□ -1.33
TY1A-NL1Q12391 DRE2YKR071C 1047 nt6.73□□□□□ -1.33
TY1A-NL1Q12391 YBR027CYBR027C 333 nt6.73□□□□□ -1.33
TY1A-NL1Q12391 SGV1YPR161C 1974 nt6.73□□□□□ -1.33
TY1A-NL1Q12391 PMT2YAL023C 2280 nt6.73□□□□□ -1.33
TY1A-NL1Q12391 ENB1YOL158C 1821 nt6.72□□□□□ -1.33
TY1A-NL1Q12391 NSE3YDR288W 912 nt6.72□□□□□ -1.33
TY1A-NL1Q12391 YJL064WYJL064W 396 nt6.72□□□□□ -1.33
TY1A-NL1Q12391 PRY2YKR013W 990 nt6.72□□□□□ -1.33
TY1A-NL1Q12391 DAL80YKR034W 810 nt6.72□□□□□ -1.33
TY1A-NL1Q12391 YNR001W-AYNR001W-A 219 nt6.72□□□□□ -1.33
TY1A-NL1Q12391 TED1YIL039W 1422 nt6.72□□□□□ -1.33
TY1A-NL1Q12391 STE3YKL178C 1413 nt6.71□□□□□ -1.34
TY1A-NL1Q12391 YDR327WYDR327W 327 nt6.71□□□□□ -1.34
TY1A-NL1Q12391 YGL260WYGL260W 231 nt6.71□□□□□ -1.34
TY1A-NL1Q12391 YJL032WYJL032W 315 nt6.71□□□□□ -1.34
TY1A-NL1Q12391 YJL160CYJL160C 864 nt6.71□□□□□ -1.34
TY1A-NL1Q12391 AAH1YNL141W 1044 nt6.71□□□□□ -1.34
TY1A-NL1Q12391 ODC2YOR222W 924 nt6.71□□□□□ -1.34
TY1A-NL1Q12391 YPR160C-AYPR160C-A 285 nt6.71□□□□□ -1.34
TY1A-NL1Q12391 RXT2YBR095C 1293 nt6.71□□□□□ -1.34
TY1A-NL1Q12391 BUD9YGR041W 1644 nt6.71□□□□□ -1.34
TY1A-NL1Q12391 YLR108CYLR108C 1458 nt6.71□□□□□ -1.34
TY1A-NL1Q12391 UBP8YMR223W 1416 nt6.7□□□□□ -1.34
TY1A-NL1Q12391 CDC16YKL022C 2523 nt6.7□□□□□ -1.34
TY1A-NL1Q12391 SRG1SRG1 551 nt6.7□□□□□ -1.34
TY1A-NL1Q12391 PAN5YHR063C 1140 nt6.7□□□□□ -1.34
TY1A-NL1Q12391 HRA1HRA1 564 nt6.7□□□□□ -1.34
TY1A-NL1Q12391 ARG8YOL140W 1272 nt6.7□□□□□ -1.34
TY1A-NL1Q12391 YOR097CYOR097C 528 nt6.7□□□□□ -1.34
TY1A-NL1Q12391 SUI3YPL237W 858 nt6.7□□□□□ -1.34
TY1A-NL1Q12391 ABD1YBR236C 1311 nt6.7□□□□□ -1.34
TY1A-NL1Q12391 HSE1YHL002W 1359 nt6.69□□□□□ -1.34
TY1A-NL1Q12391 MAS2YHR024C 1449 nt6.69□□□□□ -1.34
TY1A-NL1Q12391 RRG1YDR065W 1098 nt6.69□□□□□ -1.34
TY1A-NL1Q12391 POL32YJR043C 1053 nt6.69□□□□□ -1.34
TY1A-NL1Q12391 YKL147CYKL147C 618 nt6.69□□□□□ -1.34
TY1A-NL1Q12391 ADE1YAR015W 921 nt6.69□□□□□ -1.34
TY1A-NL1Q12391 APT1YML022W 564 nt6.69□□□□□ -1.34
TY1A-NL1Q12391 YML034C-AYML034C-A 399 nt6.69□□□□□ -1.34
TY1A-NL1Q12391 PAU19YMR325W 375 nt6.69□□□□□ -1.34
TY1A-NL1Q12391 SMA1YPL027W 738 nt6.69□□□□□ -1.34
TY1A-NL1Q12391 SET6YPL165C 1122 nt6.69□□□□□ -1.34
TY1A-NL1Q12391 YNL295WYNL295W 1575 nt6.69□□□□□ -1.34
TY1A-NL1Q12391 CCR4YAL021C 2514 nt6.69□□□□□ -1.34
TY1A-NL1Q12391 FCY2YER056C 1602 nt6.68□□□□□ -1.34
TY1A-NL1Q12391 NDE1YMR145C 1683 nt6.68□□□□□ -1.34
TY1A-NL1Q12391 MEK1YOR351C 1494 nt6.68□□□□□ -1.34
TY1A-NL1Q12391 YEL028WYEL028W 462 nt6.68□□□□□ -1.34
TY1A-NL1Q12391 YGL177WYGL177W 348 nt6.68□□□□□ -1.34
TY1A-NL1Q12391 SPO11YHL022C 1197 nt6.68□□□□□ -1.34
TY1A-NL1Q12391 MRPL49YJL096W 486 nt6.68□□□□□ -1.34
TY1A-NL1Q12391 DID2YKR035W-A 615 nt6.68□□□□□ -1.34
TY1A-NL1Q12391 YLR222C-AYLR222C-A 231 nt6.68□□□□□ -1.34
TY1A-NL1Q12391 SRT1YMR101C 1032 nt6.68□□□□□ -1.34
TY1A-NL1Q12391 LIP5YOR196C 1245 nt6.68□□□□□ -1.34
TY1A-NL1Q12391 RFM1YOR279C 933 nt6.68□□□□□ -1.34
TY1A-NL1Q12391 RFS1YBR052C 633 nt6.68□□□□□ -1.34
TY1A-NL1Q12391 AFG2YLR397C 2343 nt6.68□□□□□ -1.34
TY1A-NL1Q12391 TEC1YBR083W 1461 nt6.67□□□□□ -1.34
TY1A-NL1Q12391 BAP3YDR046C 1815 nt6.67□□□□□ -1.34
TY1A-NL1Q12391 HEM3YDL205C 984 nt6.67□□□□□ -1.34
TY1A-NL1Q12391 SWM1YDR260C 513 nt6.67□□□□□ -1.34
TY1A-NL1Q12391 CLC1YGR167W 702 nt6.67□□□□□ -1.34
TY1A-NL1Q12391 YUR1YJL139C 1287 nt6.67□□□□□ -1.34
TY1A-NL1Q12391 RSM26YJR101W 801 nt6.67□□□□□ -1.34
TY1A-NL1Q12391 PSR1YLL010C 1284 nt6.67□□□□□ -1.34
TY1A-NL1Q12391 YBL036CYBL036C 774 nt6.67□□□□□ -1.34
TY1A-NL1Q12391 RUF20RUF20 443 nt6.67□□□□□ -1.34
TY1A-NL1Q12391 FYV6YNL133C 522 nt6.67□□□□□ -1.34
TY1A-NL1Q12391 YDR514CYDR514C 1452 nt6.66□□□□□ -1.34
TY1A-NL1Q12391 AFG3YER017C 2286 nt6.66□□□□□ -1.34
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