Protein–RNA interactions for Protein: Q04368

CSI1, Cop9 signalosome-interactor 1, yeastyeast

Predictions only

Length 295 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CSI1Q04368 COR1YBL045C 1374 nt7.28□□□□□ -1.24
CSI1Q04368 GYP8YFL027C 1494 nt7.28□□□□□ -1.24
CSI1Q04368 TPO3YPR156C 1869 nt7.28□□□□□ -1.24
CSI1Q04368 NTE1YML059C 5040 nt7.27□□□□□ -1.24
CSI1Q04368 YDL022C-AYDL022C-A 249 nt7.27□□□□□ -1.25
CSI1Q04368 FPR2YDR519W 408 nt7.27□□□□□ -1.25
CSI1Q04368 PRS2YER099C 957 nt7.27□□□□□ -1.25
CSI1Q04368 LEU5YHR002W 1074 nt7.27□□□□□ -1.25
CSI1Q04368 EFM3YJR129C 1020 nt7.27□□□□□ -1.25
CSI1Q04368 MGM101YJR144W 810 nt7.27□□□□□ -1.25
CSI1Q04368 YML012C-AYML012C-A 378 nt7.27□□□□□ -1.25
CSI1Q04368 CLN1YMR199W 1641 nt7.27□□□□□ -1.25
CSI1Q04368 EDC3YEL015W 1656 nt7.26□□□□□ -1.25
CSI1Q04368 PKC1YBL105C 3456 nt7.26□□□□□ -1.25
CSI1Q04368 DFM1YDR411C 1026 nt7.26□□□□□ -1.25
CSI1Q04368 YOR200WYOR200W 399 nt7.26□□□□□ -1.25
CSI1Q04368 RGT2YDL138W 2292 nt7.26□□□□□ -1.25
CSI1Q04368 GUT1YHL032C 2130 nt7.25□□□□□ -1.25
CSI1Q04368 CBK1YNL161W 2271 nt7.25□□□□□ -1.25
CSI1Q04368 GPB2YAL056W 2643 nt7.25□□□□□ -1.25
CSI1Q04368 YUR1YJL139C 1287 nt7.25□□□□□ -1.25
CSI1Q04368 AFG1YEL052W 1530 nt7.25□□□□□ -1.25
CSI1Q04368 CNE1YAL058W 1509 nt7.24□□□□□ -1.25
CSI1Q04368 PGK1YCR012W 1251 nt7.24□□□□□ -1.25
CSI1Q04368 UGX2YDL169C 672 nt7.24□□□□□ -1.25
CSI1Q04368 SPO7YAL009W 780 nt7.24□□□□□ -1.25
CSI1Q04368 YOL036WYOL036W 2286 nt7.24□□□□□ -1.25
CSI1Q04368 UBC11YOR339C 471 nt7.23□□□□□ -1.25
CSI1Q04368 MRPS5YBR251W 924 nt7.23□□□□□ -1.25
CSI1Q04368 PRI2YKL045W 1587 nt7.23□□□□□ -1.25
CSI1Q04368 PRP24YMR268C 1335 nt7.23□□□□□ -1.25
CSI1Q04368 PXL1YKR090W 2121 nt7.22□□□□□ -1.25
CSI1Q04368 RPN11YFR004W 921 nt7.21□□□□□ -1.26
CSI1Q04368 ARA2YMR041C 1008 nt7.21□□□□□ -1.26
CSI1Q04368 SHP1YBL058W 1272 nt7.21□□□□□ -1.26
CSI1Q04368 ATG12YBR217W 561 nt7.21□□□□□ -1.26
CSI1Q04368 FET4YMR319C 1659 nt7.21□□□□□ -1.26
CSI1Q04368 ISN1YOR155C 1353 nt7.2□□□□□ -1.26
CSI1Q04368 SEN34YAR008W 828 nt7.2□□□□□ -1.26
CSI1Q04368 ICT1YLR099C 1185 nt7.2□□□□□ -1.26
CSI1Q04368 AGP2YBR132C 1791 nt7.2□□□□□ -1.26
CSI1Q04368 GIT1YCR098C 1557 nt7.2□□□□□ -1.26
CSI1Q04368 APE3YBR286W 1614 nt7.19□□□□□ -1.26
CSI1Q04368 ISC1YER019W 1434 nt7.19□□□□□ -1.26
CSI1Q04368 MNN5YJL186W 1761 nt7.19□□□□□ -1.26
CSI1Q04368 YOL163WYOL163W 510 nt7.19□□□□□ -1.26
CSI1Q04368 YDR109CYDR109C 2148 nt7.19□□□□□ -1.26
CSI1Q04368 SUP19tS(UGA)E 82 nt7.17□□□□□ -1.26
CSI1Q04368 SUP17tS(UGA)I 82 nt7.17□□□□□ -1.26
CSI1Q04368 SUP16tS(UGA)P 82 nt7.17□□□□□ -1.26
CSI1Q04368 CIS3YJL158C 684 nt7.17□□□□□ -1.26
CSI1Q04368 KNS1YLL019C 2214 nt7.17□□□□□ -1.26
CSI1Q04368 RAD3YER171W 2337 nt7.16□□□□□ -1.26
CSI1Q04368 YDL144CYDL144C 1071 nt7.16□□□□□ -1.26
CSI1Q04368 DJP1YIR004W 1299 nt7.16□□□□□ -1.26
CSI1Q04368 YJU3YKL094W 942 nt7.16□□□□□ -1.26
CSI1Q04368 AAD15YOL165C 432 nt7.16□□□□□ -1.26
CSI1Q04368 IMA5YJL216C 1746 nt7.15□□□□□ -1.26
CSI1Q04368 SUP2tY(GUA)D 75 nt7.15□□□□□ -1.26
CSI1Q04368 SUP11tY(GUA)F1 75 nt7.15□□□□□ -1.26
CSI1Q04368 SUP6tY(GUA)F2 75 nt7.15□□□□□ -1.26
CSI1Q04368 SUP7tY(GUA)J1 75 nt7.15□□□□□ -1.26
CSI1Q04368 SUP4tY(GUA)J2 75 nt7.15□□□□□ -1.26
CSI1Q04368 SUP5tY(GUA)M1 75 nt7.15□□□□□ -1.26
CSI1Q04368 SUP8tY(GUA)M2 75 nt7.15□□□□□ -1.26
CSI1Q04368 SUP3tY(GUA)O 75 nt7.15□□□□□ -1.26
CSI1Q04368 ASK1YKL052C 879 nt7.15□□□□□ -1.26
CSI1Q04368 YNR040WYNR040W 771 nt7.15□□□□□ -1.26
CSI1Q04368 YPR123CYPR123C 435 nt7.15□□□□□ -1.26
CSI1Q04368 MRK1YDL079C 1506 nt7.15□□□□□ -1.27
CSI1Q04368 YBR144CYBR144C 315 nt7.14□□□□□ -1.27
CSI1Q04368 IFA38YBR159W 1044 nt7.14□□□□□ -1.27
CSI1Q04368 SEC20YDR498C 1152 nt7.13□□□□□ -1.27
CSI1Q04368 SNN1YNL086W 309 nt7.13□□□□□ -1.27
CSI1Q04368 RRP4YHR069C 1080 nt7.12□□□□□ -1.27
CSI1Q04368 RPE1YJL121C 717 nt7.12□□□□□ -1.27
CSI1Q04368 UBP13YBL067C 2244 nt7.12□□□□□ -1.27
CSI1Q04368 XBP1YIL101C 1944 nt7.11□□□□□ -1.27
CSI1Q04368 RPS9AYPL081W 594 nt7.11□□□□□ -1.27
CSI1Q04368 ATO3YDR384C 828 nt7.09□□□□□ -1.27
CSI1Q04368 HAP2YGL237C 798 nt7.09□□□□□ -1.27
CSI1Q04368 RME1YGR044C 903 nt7.09□□□□□ -1.27
CSI1Q04368 EGD2YHR193C 525 nt7.09□□□□□ -1.27
CSI1Q04368 MRS1YIR021W 1092 nt7.09□□□□□ -1.27
CSI1Q04368 VMA4YOR332W 702 nt7.09□□□□□ -1.27
CSI1Q04368 ERC1YHR032W 1746 nt7.08□□□□□ -1.28
CSI1Q04368 YDL114WYDL114W 927 nt7.08□□□□□ -1.28
CSI1Q04368 SNO4YMR322C 714 nt7.08□□□□□ -1.28
CSI1Q04368 HSP33YOR391C 714 nt7.08□□□□□ -1.28
CSI1Q04368 YBR056C-BYBR056C-B 159 nt7.08□□□□□ -1.28
CSI1Q04368 HSP32YPL280W 714 nt7.08□□□□□ -1.28
CSI1Q04368 PUF3YLL013C 2640 nt7.08□□□□□ -1.28
CSI1Q04368 GAT1YFL021W 1533 nt7.07□□□□□ -1.28
CSI1Q04368 VRP1YLR337C 2454 nt7.07□□□□□ -1.28
CSI1Q04368 YML082WYML082W 1950 nt7.07□□□□□ -1.28
CSI1Q04368 DIA3YDL024C 1407 nt7.07□□□□□ -1.28
CSI1Q04368 AVT4YNL101W 2142 nt7.07□□□□□ -1.28
CSI1Q04368 COX9YDL067C 180 nt7.06□□□□□ -1.28
CSI1Q04368 APS3YJL024C 585 nt7.06□□□□□ -1.28
CSI1Q04368 TAL1YLR354C 1008 nt7.06□□□□□ -1.28
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