Protein–RNA interactions for Protein: Q02535

ID3, DNA-binding protein inhibitor ID-3, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ID3Q02535 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ID3Q02535 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ID3Q02535 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
ID3Q02535 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
ID3Q02535 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
ID3Q02535 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ID3Q02535 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ID3Q02535 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
ID3Q02535 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
ID3Q02535 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC19.39■□□□□ 0.7
ID3Q02535 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ID3Q02535 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ID3Q02535 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ID3Q02535 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ID3Q02535 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ID3Q02535 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ID3Q02535 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ID3Q02535 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ID3Q02535 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
ID3Q02535 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ID3Q02535 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ID3Q02535 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ID3Q02535 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ID3Q02535 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ID3Q02535 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ID3Q02535 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ID3Q02535 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ID3Q02535 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ID3Q02535 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ID3Q02535 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ID3Q02535 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ID3Q02535 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ID3Q02535 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ID3Q02535 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ID3Q02535 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ID3Q02535 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ID3Q02535 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ID3Q02535 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ID3Q02535 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ID3Q02535 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ID3Q02535 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ID3Q02535 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ID3Q02535 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ID3Q02535 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ID3Q02535 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ID3Q02535 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ID3Q02535 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ID3Q02535 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ID3Q02535 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ID3Q02535 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ID3Q02535 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ID3Q02535 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
ID3Q02535 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ID3Q02535 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ID3Q02535 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ID3Q02535 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ID3Q02535 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ID3Q02535 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
ID3Q02535 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.69
ID3Q02535 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ID3Q02535 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ID3Q02535 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ID3Q02535 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ID3Q02535 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ID3Q02535 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ID3Q02535 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
ID3Q02535 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ID3Q02535 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ID3Q02535 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ID3Q02535 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ID3Q02535 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ID3Q02535 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ID3Q02535 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
ID3Q02535 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ID3Q02535 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ID3Q02535 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ID3Q02535 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ID3Q02535 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
ID3Q02535 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
ID3Q02535 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ID3Q02535 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ID3Q02535 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ID3Q02535 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ID3Q02535 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ID3Q02535 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ID3Q02535 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ID3Q02535 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ID3Q02535 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ID3Q02535 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ID3Q02535 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ID3Q02535 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ID3Q02535 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ID3Q02535 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ID3Q02535 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ID3Q02535 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ID3Q02535 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ID3Q02535 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ID3Q02535 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ID3Q02535 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ID3Q02535 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms