Protein–RNA interactions for Protein: Q00653

NFKB2, Nuclear factor NF-kappa-B p100 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 900 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKB2Q00653 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NFKB2Q00653 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NFKB2Q00653 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
NFKB2Q00653 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NFKB2Q00653 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NFKB2Q00653 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NFKB2Q00653 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NFKB2Q00653 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NFKB2Q00653 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
NFKB2Q00653 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NFKB2Q00653 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NFKB2Q00653 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NFKB2Q00653 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NFKB2Q00653 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NFKB2Q00653 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NFKB2Q00653 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NFKB2Q00653 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NFKB2Q00653 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
NFKB2Q00653 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NFKB2Q00653 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
NFKB2Q00653 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NFKB2Q00653 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NFKB2Q00653 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NFKB2Q00653 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
NFKB2Q00653 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NFKB2Q00653 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NFKB2Q00653 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NFKB2Q00653 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NFKB2Q00653 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NFKB2Q00653 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NFKB2Q00653 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NFKB2Q00653 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NFKB2Q00653 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NFKB2Q00653 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NFKB2Q00653 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NFKB2Q00653 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NFKB2Q00653 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NFKB2Q00653 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NFKB2Q00653 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NFKB2Q00653 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
NFKB2Q00653 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
NFKB2Q00653 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
NFKB2Q00653 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NFKB2Q00653 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
NFKB2Q00653 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NFKB2Q00653 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NFKB2Q00653 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NFKB2Q00653 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NFKB2Q00653 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NFKB2Q00653 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NFKB2Q00653 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NFKB2Q00653 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NFKB2Q00653 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NFKB2Q00653 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NFKB2Q00653 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NFKB2Q00653 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NFKB2Q00653 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NFKB2Q00653 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NFKB2Q00653 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NFKB2Q00653 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NFKB2Q00653 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NFKB2Q00653 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NFKB2Q00653 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NFKB2Q00653 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NFKB2Q00653 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NFKB2Q00653 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NFKB2Q00653 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NFKB2Q00653 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NFKB2Q00653 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NFKB2Q00653 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NFKB2Q00653 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NFKB2Q00653 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NFKB2Q00653 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NFKB2Q00653 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NFKB2Q00653 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
NFKB2Q00653 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NFKB2Q00653 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NFKB2Q00653 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NFKB2Q00653 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NFKB2Q00653 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NFKB2Q00653 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
NFKB2Q00653 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NFKB2Q00653 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NFKB2Q00653 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NFKB2Q00653 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NFKB2Q00653 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NFKB2Q00653 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NFKB2Q00653 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NFKB2Q00653 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
NFKB2Q00653 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NFKB2Q00653 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NFKB2Q00653 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NFKB2Q00653 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NFKB2Q00653 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NFKB2Q00653 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NFKB2Q00653 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NFKB2Q00653 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NFKB2Q00653 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NFKB2Q00653 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NFKB2Q00653 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms