Protein–RNA interactions for Protein: Q00537

CDK17, Cyclin-dependent kinase 17, humanhuman

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK17Q00537 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CDK17Q00537 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CDK17Q00537 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CDK17Q00537 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC26■■□□□ 1.75
CDK17Q00537 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CDK17Q00537 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CDK17Q00537 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CDK17Q00537 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CDK17Q00537 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CDK17Q00537 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CDK17Q00537 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CDK17Q00537 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CDK17Q00537 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
CDK17Q00537 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CDK17Q00537 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CDK17Q00537 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CDK17Q00537 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CDK17Q00537 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CDK17Q00537 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CDK17Q00537 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CDK17Q00537 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CDK17Q00537 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CDK17Q00537 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
CDK17Q00537 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CDK17Q00537 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
CDK17Q00537 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CDK17Q00537 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CDK17Q00537 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CDK17Q00537 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CDK17Q00537 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CDK17Q00537 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CDK17Q00537 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CDK17Q00537 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CDK17Q00537 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CDK17Q00537 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CDK17Q00537 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CDK17Q00537 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CDK17Q00537 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CDK17Q00537 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CDK17Q00537 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CDK17Q00537 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CDK17Q00537 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CDK17Q00537 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CDK17Q00537 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CDK17Q00537 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CDK17Q00537 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CDK17Q00537 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CDK17Q00537 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CDK17Q00537 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CDK17Q00537 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CDK17Q00537 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CDK17Q00537 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CDK17Q00537 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CDK17Q00537 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CDK17Q00537 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CDK17Q00537 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CDK17Q00537 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CDK17Q00537 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CDK17Q00537 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CDK17Q00537 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CDK17Q00537 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CDK17Q00537 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CDK17Q00537 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CDK17Q00537 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CDK17Q00537 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CDK17Q00537 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CDK17Q00537 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
CDK17Q00537 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CDK17Q00537 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CDK17Q00537 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CDK17Q00537 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CDK17Q00537 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CDK17Q00537 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CDK17Q00537 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CDK17Q00537 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CDK17Q00537 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CDK17Q00537 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CDK17Q00537 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CDK17Q00537 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
CDK17Q00537 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
CDK17Q00537 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CDK17Q00537 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CDK17Q00537 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CDK17Q00537 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CDK17Q00537 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CDK17Q00537 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CDK17Q00537 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CDK17Q00537 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CDK17Q00537 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CDK17Q00537 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CDK17Q00537 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CDK17Q00537 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CDK17Q00537 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CDK17Q00537 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CDK17Q00537 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CDK17Q00537 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CDK17Q00537 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CDK17Q00537 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CDK17Q00537 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CDK17Q00537 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms