Protein–RNA interactions for Protein: P58215

LOXL3, Lysyl oxidase homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXL3P58215 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
LOXL3P58215 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
LOXL3P58215 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
LOXL3P58215 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
LOXL3P58215 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
LOXL3P58215 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
LOXL3P58215 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
LOXL3P58215 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
LOXL3P58215 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
LOXL3P58215 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
LOXL3P58215 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
LOXL3P58215 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
LOXL3P58215 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
LOXL3P58215 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
LOXL3P58215 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
LOXL3P58215 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
LOXL3P58215 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
LOXL3P58215 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
LOXL3P58215 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
LOXL3P58215 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
LOXL3P58215 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
LOXL3P58215 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
LOXL3P58215 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
LOXL3P58215 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
LOXL3P58215 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
LOXL3P58215 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
LOXL3P58215 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
LOXL3P58215 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
LOXL3P58215 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
LOXL3P58215 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
LOXL3P58215 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
LOXL3P58215 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
LOXL3P58215 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
LOXL3P58215 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
LOXL3P58215 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
LOXL3P58215 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
LOXL3P58215 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
LOXL3P58215 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
LOXL3P58215 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
LOXL3P58215 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
LOXL3P58215 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
LOXL3P58215 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
LOXL3P58215 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
LOXL3P58215 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
LOXL3P58215 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
LOXL3P58215 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
LOXL3P58215 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
LOXL3P58215 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
LOXL3P58215 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
LOXL3P58215 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
LOXL3P58215 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
LOXL3P58215 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
LOXL3P58215 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
LOXL3P58215 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
LOXL3P58215 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
LOXL3P58215 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
LOXL3P58215 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
LOXL3P58215 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
LOXL3P58215 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
LOXL3P58215 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
LOXL3P58215 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
LOXL3P58215 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
LOXL3P58215 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
LOXL3P58215 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
LOXL3P58215 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
LOXL3P58215 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
LOXL3P58215 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
LOXL3P58215 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
LOXL3P58215 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
LOXL3P58215 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
LOXL3P58215 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
LOXL3P58215 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
LOXL3P58215 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
LOXL3P58215 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
LOXL3P58215 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
LOXL3P58215 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
LOXL3P58215 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
LOXL3P58215 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
LOXL3P58215 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
LOXL3P58215 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
LOXL3P58215 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
LOXL3P58215 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
LOXL3P58215 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
LOXL3P58215 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
LOXL3P58215 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
LOXL3P58215 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
LOXL3P58215 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
LOXL3P58215 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
LOXL3P58215 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
LOXL3P58215 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
LOXL3P58215 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
LOXL3P58215 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
LOXL3P58215 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
LOXL3P58215 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
LOXL3P58215 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
LOXL3P58215 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
LOXL3P58215 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
LOXL3P58215 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
LOXL3P58215 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
LOXL3P58215 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms