Protein–RNA interactions for Protein: P56915

GSC, Homeobox protein goosecoid, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSCP56915 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GSCP56915 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GSCP56915 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GSCP56915 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GSCP56915 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
GSCP56915 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GSCP56915 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GSCP56915 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GSCP56915 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GSCP56915 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GSCP56915 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
GSCP56915 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GSCP56915 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GSCP56915 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GSCP56915 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GSCP56915 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GSCP56915 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GSCP56915 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GSCP56915 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
GSCP56915 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GSCP56915 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GSCP56915 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
GSCP56915 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GSCP56915 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GSCP56915 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GSCP56915 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GSCP56915 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GSCP56915 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GSCP56915 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GSCP56915 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GSCP56915 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GSCP56915 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
GSCP56915 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
GSCP56915 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
GSCP56915 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
GSCP56915 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GSCP56915 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GSCP56915 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
GSCP56915 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GSCP56915 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GSCP56915 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GSCP56915 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GSCP56915 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GSCP56915 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GSCP56915 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GSCP56915 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GSCP56915 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GSCP56915 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GSCP56915 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GSCP56915 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GSCP56915 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GSCP56915 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GSCP56915 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GSCP56915 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GSCP56915 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
GSCP56915 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GSCP56915 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GSCP56915 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GSCP56915 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GSCP56915 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GSCP56915 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GSCP56915 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GSCP56915 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GSCP56915 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
GSCP56915 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GSCP56915 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GSCP56915 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GSCP56915 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
GSCP56915 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GSCP56915 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GSCP56915 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GSCP56915 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GSCP56915 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GSCP56915 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
GSCP56915 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GSCP56915 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GSCP56915 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
GSCP56915 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GSCP56915 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GSCP56915 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GSCP56915 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GSCP56915 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GSCP56915 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GSCP56915 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GSCP56915 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GSCP56915 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GSCP56915 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GSCP56915 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GSCP56915 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GSCP56915 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GSCP56915 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GSCP56915 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GSCP56915 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GSCP56915 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GSCP56915 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
GSCP56915 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GSCP56915 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GSCP56915 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GSCP56915 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GSCP56915 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms