Protein–RNA interactions for Protein: P55822

SH3BGR, SH3 domain-binding glutamic acid-rich protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BGRP55822 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SH3BGRP55822 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SH3BGRP55822 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SH3BGRP55822 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SH3BGRP55822 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SH3BGRP55822 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SH3BGRP55822 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SH3BGRP55822 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SH3BGRP55822 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SH3BGRP55822 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SH3BGRP55822 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SH3BGRP55822 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SH3BGRP55822 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SH3BGRP55822 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SH3BGRP55822 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SH3BGRP55822 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SH3BGRP55822 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SH3BGRP55822 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SH3BGRP55822 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SH3BGRP55822 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SH3BGRP55822 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SH3BGRP55822 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SH3BGRP55822 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SH3BGRP55822 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SH3BGRP55822 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SH3BGRP55822 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SH3BGRP55822 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SH3BGRP55822 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SH3BGRP55822 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SH3BGRP55822 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SH3BGRP55822 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SH3BGRP55822 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SH3BGRP55822 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SH3BGRP55822 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SH3BGRP55822 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SH3BGRP55822 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SH3BGRP55822 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SH3BGRP55822 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SH3BGRP55822 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SH3BGRP55822 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SH3BGRP55822 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SH3BGRP55822 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SH3BGRP55822 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SH3BGRP55822 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SH3BGRP55822 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SH3BGRP55822 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SH3BGRP55822 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SH3BGRP55822 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SH3BGRP55822 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SH3BGRP55822 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SH3BGRP55822 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SH3BGRP55822 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SH3BGRP55822 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SH3BGRP55822 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SH3BGRP55822 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SH3BGRP55822 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SH3BGRP55822 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SH3BGRP55822 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SH3BGRP55822 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SH3BGRP55822 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SH3BGRP55822 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SH3BGRP55822 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SH3BGRP55822 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SH3BGRP55822 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SH3BGRP55822 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SH3BGRP55822 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SH3BGRP55822 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SH3BGRP55822 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SH3BGRP55822 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SH3BGRP55822 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SH3BGRP55822 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SH3BGRP55822 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SH3BGRP55822 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SH3BGRP55822 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SH3BGRP55822 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SH3BGRP55822 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SH3BGRP55822 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SH3BGRP55822 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SH3BGRP55822 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SH3BGRP55822 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SH3BGRP55822 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SH3BGRP55822 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SH3BGRP55822 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SH3BGRP55822 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SH3BGRP55822 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SH3BGRP55822 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SH3BGRP55822 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SH3BGRP55822 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SH3BGRP55822 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SH3BGRP55822 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SH3BGRP55822 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SH3BGRP55822 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SH3BGRP55822 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SH3BGRP55822 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SH3BGRP55822 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SH3BGRP55822 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SH3BGRP55822 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SH3BGRP55822 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SH3BGRP55822 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SH3BGRP55822 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1645.3 ms