Protein–RNA interactions for Protein: P53708

ITGA8, Integrin alpha-8, humanhuman

Predictions only

Length 1,063 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA8P53708 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ITGA8P53708 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ITGA8P53708 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ITGA8P53708 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ITGA8P53708 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ITGA8P53708 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ITGA8P53708 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ITGA8P53708 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ITGA8P53708 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ITGA8P53708 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ITGA8P53708 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ITGA8P53708 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ITGA8P53708 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ITGA8P53708 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ITGA8P53708 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ITGA8P53708 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ITGA8P53708 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ITGA8P53708 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ITGA8P53708 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ITGA8P53708 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ITGA8P53708 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ITGA8P53708 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ITGA8P53708 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ITGA8P53708 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ITGA8P53708 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ITGA8P53708 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ITGA8P53708 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ITGA8P53708 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ITGA8P53708 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ITGA8P53708 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ITGA8P53708 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ITGA8P53708 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
ITGA8P53708 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ITGA8P53708 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ITGA8P53708 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ITGA8P53708 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
ITGA8P53708 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ITGA8P53708 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ITGA8P53708 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ITGA8P53708 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ITGA8P53708 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ITGA8P53708 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ITGA8P53708 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ITGA8P53708 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ITGA8P53708 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ITGA8P53708 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ITGA8P53708 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ITGA8P53708 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ITGA8P53708 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ITGA8P53708 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ITGA8P53708 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ITGA8P53708 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ITGA8P53708 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ITGA8P53708 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ITGA8P53708 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ITGA8P53708 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ITGA8P53708 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ITGA8P53708 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ITGA8P53708 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ITGA8P53708 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ITGA8P53708 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ITGA8P53708 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ITGA8P53708 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ITGA8P53708 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ITGA8P53708 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ITGA8P53708 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ITGA8P53708 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
ITGA8P53708 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ITGA8P53708 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ITGA8P53708 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ITGA8P53708 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ITGA8P53708 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ITGA8P53708 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ITGA8P53708 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
ITGA8P53708 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ITGA8P53708 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
ITGA8P53708 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ITGA8P53708 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ITGA8P53708 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ITGA8P53708 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ITGA8P53708 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ITGA8P53708 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ITGA8P53708 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ITGA8P53708 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
ITGA8P53708 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ITGA8P53708 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ITGA8P53708 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ITGA8P53708 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ITGA8P53708 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ITGA8P53708 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ITGA8P53708 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ITGA8P53708 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ITGA8P53708 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ITGA8P53708 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ITGA8P53708 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ITGA8P53708 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ITGA8P53708 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
ITGA8P53708 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ITGA8P53708 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ITGA8P53708 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms