Protein–RNA interactions for Protein: P53539

FOSB, Protein fosB, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOSBP53539 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
FOSBP53539 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
FOSBP53539 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
FOSBP53539 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
FOSBP53539 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
FOSBP53539 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
FOSBP53539 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
FOSBP53539 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
FOSBP53539 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
FOSBP53539 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
FOSBP53539 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
FOSBP53539 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
FOSBP53539 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
FOSBP53539 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
FOSBP53539 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
FOSBP53539 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
FOSBP53539 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
FOSBP53539 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
FOSBP53539 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
FOSBP53539 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
FOSBP53539 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
FOSBP53539 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
FOSBP53539 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
FOSBP53539 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC27.94■■■□□ 2.06
FOSBP53539 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
FOSBP53539 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
FOSBP53539 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
FOSBP53539 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
FOSBP53539 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
FOSBP53539 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
FOSBP53539 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
FOSBP53539 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
FOSBP53539 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
FOSBP53539 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
FOSBP53539 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC27.9■■■□□ 2.06
FOSBP53539 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
FOSBP53539 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
FOSBP53539 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
FOSBP53539 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
FOSBP53539 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
FOSBP53539 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
FOSBP53539 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
FOSBP53539 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
FOSBP53539 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
FOSBP53539 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
FOSBP53539 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
FOSBP53539 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
FOSBP53539 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
FOSBP53539 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
FOSBP53539 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
FOSBP53539 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
FOSBP53539 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
FOSBP53539 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
FOSBP53539 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
FOSBP53539 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
FOSBP53539 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
FOSBP53539 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
FOSBP53539 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
FOSBP53539 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
FOSBP53539 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
FOSBP53539 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
FOSBP53539 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
FOSBP53539 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
FOSBP53539 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
FOSBP53539 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
FOSBP53539 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
FOSBP53539 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
FOSBP53539 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
FOSBP53539 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
FOSBP53539 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
FOSBP53539 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
FOSBP53539 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
FOSBP53539 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
FOSBP53539 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
FOSBP53539 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
FOSBP53539 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
FOSBP53539 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
FOSBP53539 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
FOSBP53539 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
FOSBP53539 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
FOSBP53539 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
FOSBP53539 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
FOSBP53539 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
FOSBP53539 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
FOSBP53539 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
FOSBP53539 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
FOSBP53539 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
FOSBP53539 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
FOSBP53539 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
FOSBP53539 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
FOSBP53539 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
FOSBP53539 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
FOSBP53539 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
FOSBP53539 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
FOSBP53539 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
FOSBP53539 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
FOSBP53539 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
FOSBP53539 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
FOSBP53539 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
FOSBP53539 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms