Protein–RNA interactions for Protein: P52306

RAP1GDS1, Rap1 GTPase-GDP dissociation stimulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAP1GDS1P52306 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RAP1GDS1P52306 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RAP1GDS1P52306 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RAP1GDS1P52306 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RAP1GDS1P52306 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RAP1GDS1P52306 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RAP1GDS1P52306 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RAP1GDS1P52306 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RAP1GDS1P52306 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RAP1GDS1P52306 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RAP1GDS1P52306 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RAP1GDS1P52306 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RAP1GDS1P52306 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RAP1GDS1P52306 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RAP1GDS1P52306 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RAP1GDS1P52306 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RAP1GDS1P52306 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RAP1GDS1P52306 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RAP1GDS1P52306 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RAP1GDS1P52306 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RAP1GDS1P52306 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RAP1GDS1P52306 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RAP1GDS1P52306 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RAP1GDS1P52306 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RAP1GDS1P52306 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RAP1GDS1P52306 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAP1GDS1P52306 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAP1GDS1P52306 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAP1GDS1P52306 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAP1GDS1P52306 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAP1GDS1P52306 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAP1GDS1P52306 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAP1GDS1P52306 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAP1GDS1P52306 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RAP1GDS1P52306 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RAP1GDS1P52306 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
RAP1GDS1P52306 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RAP1GDS1P52306 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RAP1GDS1P52306 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RAP1GDS1P52306 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
RAP1GDS1P52306 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
RAP1GDS1P52306 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAP1GDS1P52306 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAP1GDS1P52306 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAP1GDS1P52306 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAP1GDS1P52306 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAP1GDS1P52306 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAP1GDS1P52306 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAP1GDS1P52306 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAP1GDS1P52306 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
RAP1GDS1P52306 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAP1GDS1P52306 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAP1GDS1P52306 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAP1GDS1P52306 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAP1GDS1P52306 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
RAP1GDS1P52306 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
RAP1GDS1P52306 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAP1GDS1P52306 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAP1GDS1P52306 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAP1GDS1P52306 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RAP1GDS1P52306 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RAP1GDS1P52306 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RAP1GDS1P52306 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RAP1GDS1P52306 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RAP1GDS1P52306 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RAP1GDS1P52306 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RAP1GDS1P52306 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RAP1GDS1P52306 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
RAP1GDS1P52306 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RAP1GDS1P52306 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RAP1GDS1P52306 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RAP1GDS1P52306 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RAP1GDS1P52306 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RAP1GDS1P52306 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RAP1GDS1P52306 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RAP1GDS1P52306 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RAP1GDS1P52306 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RAP1GDS1P52306 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
RAP1GDS1P52306 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RAP1GDS1P52306 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RAP1GDS1P52306 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RAP1GDS1P52306 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RAP1GDS1P52306 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RAP1GDS1P52306 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RAP1GDS1P52306 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RAP1GDS1P52306 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
RAP1GDS1P52306 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RAP1GDS1P52306 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RAP1GDS1P52306 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RAP1GDS1P52306 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RAP1GDS1P52306 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RAP1GDS1P52306 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RAP1GDS1P52306 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RAP1GDS1P52306 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RAP1GDS1P52306 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RAP1GDS1P52306 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RAP1GDS1P52306 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RAP1GDS1P52306 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RAP1GDS1P52306 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RAP1GDS1P52306 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms