Protein–RNA interactions for Protein: P50750

CDK9, Cyclin-dependent kinase 9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK9P50750 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDK9P50750 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDK9P50750 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CDK9P50750 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDK9P50750 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDK9P50750 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDK9P50750 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDK9P50750 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDK9P50750 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDK9P50750 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDK9P50750 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDK9P50750 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDK9P50750 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDK9P50750 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CDK9P50750 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDK9P50750 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDK9P50750 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDK9P50750 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDK9P50750 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDK9P50750 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CDK9P50750 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDK9P50750 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDK9P50750 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDK9P50750 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDK9P50750 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CDK9P50750 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDK9P50750 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CDK9P50750 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDK9P50750 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDK9P50750 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDK9P50750 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDK9P50750 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDK9P50750 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDK9P50750 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDK9P50750 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDK9P50750 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDK9P50750 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDK9P50750 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDK9P50750 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDK9P50750 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDK9P50750 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDK9P50750 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDK9P50750 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDK9P50750 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDK9P50750 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDK9P50750 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDK9P50750 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDK9P50750 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDK9P50750 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDK9P50750 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDK9P50750 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDK9P50750 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDK9P50750 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDK9P50750 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDK9P50750 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDK9P50750 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDK9P50750 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDK9P50750 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDK9P50750 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDK9P50750 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDK9P50750 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDK9P50750 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDK9P50750 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDK9P50750 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CDK9P50750 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDK9P50750 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDK9P50750 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDK9P50750 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDK9P50750 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDK9P50750 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDK9P50750 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDK9P50750 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDK9P50750 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDK9P50750 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDK9P50750 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDK9P50750 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
CDK9P50750 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CDK9P50750 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CDK9P50750 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDK9P50750 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDK9P50750 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDK9P50750 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDK9P50750 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDK9P50750 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDK9P50750 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDK9P50750 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDK9P50750 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDK9P50750 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDK9P50750 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDK9P50750 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDK9P50750 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDK9P50750 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDK9P50750 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDK9P50750 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDK9P50750 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CDK9P50750 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDK9P50750 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDK9P50750 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDK9P50750 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDK9P50750 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 147.3 ms