Protein–RNA interactions for Protein: P49221

TGM4, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase 4, humanhuman

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGM4P49221 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TGM4P49221 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TGM4P49221 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TGM4P49221 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TGM4P49221 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TGM4P49221 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TGM4P49221 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TGM4P49221 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TGM4P49221 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TGM4P49221 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TGM4P49221 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TGM4P49221 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TGM4P49221 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TGM4P49221 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TGM4P49221 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TGM4P49221 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TGM4P49221 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TGM4P49221 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TGM4P49221 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TGM4P49221 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TGM4P49221 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TGM4P49221 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TGM4P49221 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TGM4P49221 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TGM4P49221 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TGM4P49221 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TGM4P49221 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TGM4P49221 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TGM4P49221 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TGM4P49221 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TGM4P49221 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TGM4P49221 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
TGM4P49221 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TGM4P49221 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TGM4P49221 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TGM4P49221 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TGM4P49221 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TGM4P49221 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TGM4P49221 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TGM4P49221 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TGM4P49221 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TGM4P49221 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TGM4P49221 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TGM4P49221 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TGM4P49221 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TGM4P49221 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TGM4P49221 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TGM4P49221 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TGM4P49221 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TGM4P49221 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TGM4P49221 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TGM4P49221 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TGM4P49221 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TGM4P49221 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TGM4P49221 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TGM4P49221 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TGM4P49221 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TGM4P49221 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TGM4P49221 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TGM4P49221 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TGM4P49221 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TGM4P49221 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TGM4P49221 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TGM4P49221 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TGM4P49221 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TGM4P49221 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TGM4P49221 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TGM4P49221 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TGM4P49221 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TGM4P49221 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TGM4P49221 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TGM4P49221 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TGM4P49221 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TGM4P49221 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
TGM4P49221 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TGM4P49221 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TGM4P49221 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TGM4P49221 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TGM4P49221 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TGM4P49221 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TGM4P49221 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TGM4P49221 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TGM4P49221 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TGM4P49221 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TGM4P49221 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TGM4P49221 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.3■■□□□ 1
TGM4P49221 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TGM4P49221 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TGM4P49221 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
TGM4P49221 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC21.3■■□□□ 1
TGM4P49221 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
TGM4P49221 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TGM4P49221 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TGM4P49221 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TGM4P49221 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TGM4P49221 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TGM4P49221 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TGM4P49221 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TGM4P49221 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TGM4P49221 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms