Protein–RNA interactions for Protein: P48960

CD97, CD97 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 835 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD97P48960 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CD97P48960 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CD97P48960 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CD97P48960 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CD97P48960 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CD97P48960 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CD97P48960 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CD97P48960 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CD97P48960 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CD97P48960 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CD97P48960 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CD97P48960 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CD97P48960 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CD97P48960 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CD97P48960 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CD97P48960 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CD97P48960 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CD97P48960 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CD97P48960 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CD97P48960 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CD97P48960 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CD97P48960 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CD97P48960 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CD97P48960 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CD97P48960 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CD97P48960 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CD97P48960 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CD97P48960 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CD97P48960 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CD97P48960 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CD97P48960 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CD97P48960 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CD97P48960 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CD97P48960 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CD97P48960 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CD97P48960 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CD97P48960 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CD97P48960 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CD97P48960 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CD97P48960 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CD97P48960 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CD97P48960 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CD97P48960 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CD97P48960 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CD97P48960 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CD97P48960 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CD97P48960 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CD97P48960 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CD97P48960 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CD97P48960 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CD97P48960 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CD97P48960 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CD97P48960 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CD97P48960 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CD97P48960 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CD97P48960 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CD97P48960 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CD97P48960 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CD97P48960 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CD97P48960 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CD97P48960 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CD97P48960 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CD97P48960 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CD97P48960 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CD97P48960 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CD97P48960 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CD97P48960 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CD97P48960 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CD97P48960 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CD97P48960 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CD97P48960 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CD97P48960 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CD97P48960 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CD97P48960 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CD97P48960 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CD97P48960 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CD97P48960 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CD97P48960 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CD97P48960 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CD97P48960 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CD97P48960 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CD97P48960 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CD97P48960 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CD97P48960 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CD97P48960 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CD97P48960 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CD97P48960 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CD97P48960 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CD97P48960 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CD97P48960 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CD97P48960 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CD97P48960 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CD97P48960 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CD97P48960 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CD97P48960 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CD97P48960 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CD97P48960 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CD97P48960 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CD97P48960 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CD97P48960 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms