Protein–RNA interactions for Protein: P48723

HSPA13, Heat shock 70 kDa protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 471 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPA13P48723 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HSPA13P48723 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HSPA13P48723 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HSPA13P48723 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HSPA13P48723 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
HSPA13P48723 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HSPA13P48723 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HSPA13P48723 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HSPA13P48723 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HSPA13P48723 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HSPA13P48723 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HSPA13P48723 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HSPA13P48723 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HSPA13P48723 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HSPA13P48723 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HSPA13P48723 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HSPA13P48723 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HSPA13P48723 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HSPA13P48723 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HSPA13P48723 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HSPA13P48723 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
HSPA13P48723 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HSPA13P48723 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HSPA13P48723 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HSPA13P48723 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HSPA13P48723 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HSPA13P48723 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HSPA13P48723 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HSPA13P48723 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HSPA13P48723 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HSPA13P48723 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HSPA13P48723 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HSPA13P48723 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HSPA13P48723 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HSPA13P48723 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HSPA13P48723 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HSPA13P48723 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HSPA13P48723 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HSPA13P48723 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HSPA13P48723 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HSPA13P48723 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HSPA13P48723 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HSPA13P48723 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HSPA13P48723 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HSPA13P48723 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HSPA13P48723 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HSPA13P48723 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HSPA13P48723 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HSPA13P48723 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HSPA13P48723 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HSPA13P48723 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HSPA13P48723 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HSPA13P48723 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HSPA13P48723 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HSPA13P48723 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HSPA13P48723 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HSPA13P48723 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HSPA13P48723 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HSPA13P48723 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HSPA13P48723 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
HSPA13P48723 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HSPA13P48723 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HSPA13P48723 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HSPA13P48723 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HSPA13P48723 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HSPA13P48723 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HSPA13P48723 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HSPA13P48723 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HSPA13P48723 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HSPA13P48723 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HSPA13P48723 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HSPA13P48723 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HSPA13P48723 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HSPA13P48723 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HSPA13P48723 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HSPA13P48723 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HSPA13P48723 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HSPA13P48723 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HSPA13P48723 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HSPA13P48723 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HSPA13P48723 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HSPA13P48723 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HSPA13P48723 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HSPA13P48723 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HSPA13P48723 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HSPA13P48723 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HSPA13P48723 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HSPA13P48723 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HSPA13P48723 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HSPA13P48723 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HSPA13P48723 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HSPA13P48723 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HSPA13P48723 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HSPA13P48723 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HSPA13P48723 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HSPA13P48723 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HSPA13P48723 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
HSPA13P48723 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HSPA13P48723 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HSPA13P48723 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.3 ms