Protein–RNA interactions for Protein: P48643

CCT5, T-complex protein 1 subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT5P48643 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCT5P48643 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCT5P48643 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCT5P48643 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCT5P48643 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CCT5P48643 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCT5P48643 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCT5P48643 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCT5P48643 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCT5P48643 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCT5P48643 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCT5P48643 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCT5P48643 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCT5P48643 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCT5P48643 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCT5P48643 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCT5P48643 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCT5P48643 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCT5P48643 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCT5P48643 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCT5P48643 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCT5P48643 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCT5P48643 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCT5P48643 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCT5P48643 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCT5P48643 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCT5P48643 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCT5P48643 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCT5P48643 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCT5P48643 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCT5P48643 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCT5P48643 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCT5P48643 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCT5P48643 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCT5P48643 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCT5P48643 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCT5P48643 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCT5P48643 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCT5P48643 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCT5P48643 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCT5P48643 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCT5P48643 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCT5P48643 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCT5P48643 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CCT5P48643 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCT5P48643 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCT5P48643 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCT5P48643 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCT5P48643 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCT5P48643 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCT5P48643 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCT5P48643 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCT5P48643 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCT5P48643 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCT5P48643 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCT5P48643 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CCT5P48643 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCT5P48643 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCT5P48643 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCT5P48643 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCT5P48643 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCT5P48643 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCT5P48643 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCT5P48643 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCT5P48643 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCT5P48643 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCT5P48643 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCT5P48643 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCT5P48643 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCT5P48643 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCT5P48643 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCT5P48643 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCT5P48643 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCT5P48643 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCT5P48643 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCT5P48643 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCT5P48643 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCT5P48643 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCT5P48643 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CCT5P48643 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCT5P48643 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCT5P48643 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCT5P48643 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCT5P48643 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CCT5P48643 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCT5P48643 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCT5P48643 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCT5P48643 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCT5P48643 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCT5P48643 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CCT5P48643 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCT5P48643 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCT5P48643 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCT5P48643 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCT5P48643 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CCT5P48643 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCT5P48643 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCT5P48643 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCT5P48643 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCT5P48643 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms