Protein–RNA interactions for Protein: P45844

ABCG1, ATP-binding cassette sub-family G member 1, humanhuman

Predictions only

Length 678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCG1P45844 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ABCG1P45844 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ABCG1P45844 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ABCG1P45844 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ABCG1P45844 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ABCG1P45844 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ABCG1P45844 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ABCG1P45844 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
ABCG1P45844 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
ABCG1P45844 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ABCG1P45844 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ABCG1P45844 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ABCG1P45844 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
ABCG1P45844 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ABCG1P45844 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ABCG1P45844 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ABCG1P45844 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ABCG1P45844 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ABCG1P45844 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ABCG1P45844 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ABCG1P45844 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
ABCG1P45844 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ABCG1P45844 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ABCG1P45844 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
ABCG1P45844 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ABCG1P45844 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ABCG1P45844 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ABCG1P45844 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ABCG1P45844 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ABCG1P45844 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ABCG1P45844 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ABCG1P45844 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ABCG1P45844 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ABCG1P45844 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ABCG1P45844 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ABCG1P45844 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ABCG1P45844 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ABCG1P45844 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ABCG1P45844 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ABCG1P45844 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ABCG1P45844 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ABCG1P45844 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ABCG1P45844 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ABCG1P45844 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ABCG1P45844 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ABCG1P45844 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ABCG1P45844 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ABCG1P45844 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ABCG1P45844 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ABCG1P45844 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ABCG1P45844 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ABCG1P45844 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
ABCG1P45844 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ABCG1P45844 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ABCG1P45844 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ABCG1P45844 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ABCG1P45844 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ABCG1P45844 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ABCG1P45844 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ABCG1P45844 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ABCG1P45844 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ABCG1P45844 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ABCG1P45844 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ABCG1P45844 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ABCG1P45844 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ABCG1P45844 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ABCG1P45844 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ABCG1P45844 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ABCG1P45844 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ABCG1P45844 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ABCG1P45844 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ABCG1P45844 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
ABCG1P45844 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ABCG1P45844 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ABCG1P45844 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ABCG1P45844 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ABCG1P45844 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ABCG1P45844 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ABCG1P45844 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ABCG1P45844 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ABCG1P45844 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ABCG1P45844 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ABCG1P45844 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ABCG1P45844 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ABCG1P45844 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ABCG1P45844 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ABCG1P45844 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ABCG1P45844 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
ABCG1P45844 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ABCG1P45844 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ABCG1P45844 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ABCG1P45844 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ABCG1P45844 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ABCG1P45844 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ABCG1P45844 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
ABCG1P45844 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
ABCG1P45844 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ABCG1P45844 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ABCG1P45844 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ABCG1P45844 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms