Protein–RNA interactions for Protein: P43026

GDF5, Growth/differentiation factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF5P43026 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GDF5P43026 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GDF5P43026 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GDF5P43026 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GDF5P43026 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GDF5P43026 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GDF5P43026 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GDF5P43026 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GDF5P43026 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
GDF5P43026 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GDF5P43026 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
GDF5P43026 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GDF5P43026 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GDF5P43026 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GDF5P43026 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GDF5P43026 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GDF5P43026 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GDF5P43026 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GDF5P43026 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GDF5P43026 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GDF5P43026 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GDF5P43026 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GDF5P43026 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GDF5P43026 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
GDF5P43026 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GDF5P43026 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GDF5P43026 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GDF5P43026 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GDF5P43026 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GDF5P43026 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GDF5P43026 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
GDF5P43026 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GDF5P43026 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GDF5P43026 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GDF5P43026 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GDF5P43026 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GDF5P43026 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
GDF5P43026 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
GDF5P43026 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GDF5P43026 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GDF5P43026 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GDF5P43026 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GDF5P43026 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GDF5P43026 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GDF5P43026 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GDF5P43026 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GDF5P43026 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GDF5P43026 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GDF5P43026 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GDF5P43026 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
GDF5P43026 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
GDF5P43026 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GDF5P43026 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GDF5P43026 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GDF5P43026 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GDF5P43026 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GDF5P43026 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GDF5P43026 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GDF5P43026 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GDF5P43026 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GDF5P43026 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GDF5P43026 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GDF5P43026 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GDF5P43026 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GDF5P43026 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GDF5P43026 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GDF5P43026 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GDF5P43026 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GDF5P43026 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GDF5P43026 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GDF5P43026 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GDF5P43026 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GDF5P43026 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GDF5P43026 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GDF5P43026 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GDF5P43026 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GDF5P43026 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GDF5P43026 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GDF5P43026 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GDF5P43026 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GDF5P43026 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GDF5P43026 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GDF5P43026 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GDF5P43026 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
GDF5P43026 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GDF5P43026 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GDF5P43026 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GDF5P43026 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GDF5P43026 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GDF5P43026 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GDF5P43026 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GDF5P43026 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GDF5P43026 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GDF5P43026 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GDF5P43026 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GDF5P43026 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GDF5P43026 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GDF5P43026 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GDF5P43026 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GDF5P43026 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms