Protein–RNA interactions for Protein: P42772

CDKN2B, Cyclin-dependent kinase 4 inhibitor B, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN2BP42772 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CDKN2BP42772 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CDKN2BP42772 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDKN2BP42772 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDKN2BP42772 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDKN2BP42772 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDKN2BP42772 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDKN2BP42772 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDKN2BP42772 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDKN2BP42772 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDKN2BP42772 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDKN2BP42772 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CDKN2BP42772 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDKN2BP42772 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDKN2BP42772 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDKN2BP42772 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDKN2BP42772 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDKN2BP42772 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDKN2BP42772 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDKN2BP42772 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDKN2BP42772 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CDKN2BP42772 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CDKN2BP42772 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CDKN2BP42772 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDKN2BP42772 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDKN2BP42772 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDKN2BP42772 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDKN2BP42772 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDKN2BP42772 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDKN2BP42772 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDKN2BP42772 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDKN2BP42772 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDKN2BP42772 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CDKN2BP42772 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDKN2BP42772 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDKN2BP42772 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDKN2BP42772 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDKN2BP42772 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CDKN2BP42772 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CDKN2BP42772 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
CDKN2BP42772 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CDKN2BP42772 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDKN2BP42772 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDKN2BP42772 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDKN2BP42772 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDKN2BP42772 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDKN2BP42772 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDKN2BP42772 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDKN2BP42772 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CDKN2BP42772 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDKN2BP42772 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDKN2BP42772 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDKN2BP42772 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDKN2BP42772 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDKN2BP42772 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDKN2BP42772 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDKN2BP42772 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CDKN2BP42772 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDKN2BP42772 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDKN2BP42772 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDKN2BP42772 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CDKN2BP42772 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDKN2BP42772 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDKN2BP42772 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CDKN2BP42772 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CDKN2BP42772 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CDKN2BP42772 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CDKN2BP42772 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CDKN2BP42772 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CDKN2BP42772 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CDKN2BP42772 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDKN2BP42772 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDKN2BP42772 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDKN2BP42772 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CDKN2BP42772 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CDKN2BP42772 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CDKN2BP42772 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CDKN2BP42772 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CDKN2BP42772 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CDKN2BP42772 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDKN2BP42772 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDKN2BP42772 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDKN2BP42772 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDKN2BP42772 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDKN2BP42772 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDKN2BP42772 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDKN2BP42772 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDKN2BP42772 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDKN2BP42772 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDKN2BP42772 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDKN2BP42772 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDKN2BP42772 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CDKN2BP42772 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDKN2BP42772 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDKN2BP42772 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDKN2BP42772 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDKN2BP42772 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDKN2BP42772 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDKN2BP42772 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDKN2BP42772 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms