Protein–RNA interactions for Protein: P40889

YJL225C, Y' element ATP-dependent helicase YJL225C, yeastyeast

Predictions only

Length 1,758 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YJL225CP40889 YRF1-8YOR396W 5391 nt7.59□□□□□ -1.19
YJL225CP40889 ATO3YDR384C 828 nt7.59□□□□□ -1.2
YJL225CP40889 YKL031WYKL031W 414 nt7.58□□□□□ -1.2
YJL225CP40889 SRF1YDL133W 1314 nt7.58□□□□□ -1.2
YJL225CP40889 KIN1YDR122W 3195 nt7.57□□□□□ -1.2
YJL225CP40889 CNE1YAL058W 1509 nt7.57□□□□□ -1.2
YJL225CP40889 YDL057WYDL057W 987 nt7.56□□□□□ -1.2
YJL225CP40889 SUF5tG(CCC)O 72 nt7.56□□□□□ -1.2
YJL225CP40889 SYN8YAL014C 768 nt7.56□□□□□ -1.2
YJL225CP40889 YLR283WYLR283W 945 nt7.56□□□□□ -1.2
YJL225CP40889 SEC23YPR181C 2307 nt7.56□□□□□ -1.2
YJL225CP40889 KKQ8YKL168C 2175 nt7.56□□□□□ -1.2
YJL225CP40889 YEL023CYEL023C 2049 nt7.56□□□□□ -1.2
YJL225CP40889 YBR230W-AYBR230W-A 201 nt7.56□□□□□ -1.2
YJL225CP40889 YDR278CYDR278C 318 nt7.55□□□□□ -1.2
YJL225CP40889 SEC13YLR208W 894 nt7.55□□□□□ -1.2
YJL225CP40889 AMD1YML035C 2433 nt7.55□□□□□ -1.2
YJL225CP40889 YGR068W-AYGR068W-A 96 nt7.54□□□□□ -1.2
YJL225CP40889 ASK1YKL052C 879 nt7.54□□□□□ -1.2
YJL225CP40889 MRPL13YKR006C 795 nt7.54□□□□□ -1.2
YJL225CP40889 ORC5YNL261W 1440 nt7.54□□□□□ -1.2
YJL225CP40889 HEM14YER014W 1620 nt7.53□□□□□ -1.2
YJL225CP40889 YGL036WYGL036W 2730 nt7.53□□□□□ -1.2
YJL225CP40889 HSP12YFL014W 330 nt7.52□□□□□ -1.21
YJL225CP40889 CBP4YGR174C 513 nt7.52□□□□□ -1.21
YJL225CP40889 CCP1YKR066C 1086 nt7.52□□□□□ -1.21
YJL225CP40889 CRP1YHR146W 1398 nt7.52□□□□□ -1.21
YJL225CP40889 ICT1YLR099C 1185 nt7.51□□□□□ -1.21
YJL225CP40889 ARG81YML099C 2643 nt7.51□□□□□ -1.21
YJL225CP40889 LDS1YAL018C 978 nt7.5□□□□□ -1.21
YJL225CP40889 YML083CYML083C 1257 nt7.5□□□□□ -1.21
YJL225CP40889 PET112YBL080C 1626 nt7.5□□□□□ -1.21
YJL225CP40889 DJP1YIR004W 1299 nt7.49□□□□□ -1.21
YJL225CP40889 COX5AYNL052W 462 nt7.49□□□□□ -1.21
YJL225CP40889 YRF1-3YGR296W 5580 nt7.49□□□□□ -1.21
YJL225CP40889 YRF1-6YNL339C 5580 nt7.49□□□□□ -1.21
YJL225CP40889 YRF1-7YPL283C 5580 nt7.49□□□□□ -1.21
YJL225CP40889 KNH1YDL049C 807 nt7.48□□□□□ -1.21
YJL225CP40889 ADE13YLR359W 1449 nt7.48□□□□□ -1.21
YJL225CP40889 COA1YIL157C 594 nt7.48□□□□□ -1.21
YJL225CP40889 YHM2YMR241W 945 nt7.48□□□□□ -1.21
YJL225CP40889 YPR204WYPR204W 3099 nt7.48□□□□□ -1.21
YJL225CP40889 PYC2YBR218C 3543 nt7.47□□□□□ -1.21
YJL225CP40889 RTG2YGL252C 1767 nt7.47□□□□□ -1.21
YJL225CP40889 YCR097W-AYCR097W-A 267 nt7.46□□□□□ -1.21
YJL225CP40889 LEU5YHR002W 1074 nt7.46□□□□□ -1.21
YJL225CP40889 GTT3YEL017W 1014 nt7.46□□□□□ -1.22
YJL225CP40889 CSG2YBR036C 1233 nt7.46□□□□□ -1.22
YJL225CP40889 YMC1YPR058W 924 nt7.46□□□□□ -1.22
YJL225CP40889 BRL1YHR036W 1416 nt7.46□□□□□ -1.22
YJL225CP40889 ERG3YLR056W 1098 nt7.45□□□□□ -1.22
YJL225CP40889 PNP1YLR209C 936 nt7.45□□□□□ -1.22
YJL225CP40889 SES1YDR023W 1389 nt7.45□□□□□ -1.22
YJL225CP40889 PPS1YBR276C 2424 nt7.44□□□□□ -1.22
YJL225CP40889 PAN6YIL145C 930 nt7.44□□□□□ -1.22
YJL225CP40889 QNS1YHR074W 2145 nt7.44□□□□□ -1.22
YJL225CP40889 GYP8YFL027C 1494 nt7.44□□□□□ -1.22
YJL225CP40889 TEP1YNL128W 1305 nt7.44□□□□□ -1.22
YJL225CP40889 NUD1YOR373W 2556 nt7.44□□□□□ -1.22
YJL225CP40889 ATO2YNR002C 849 nt7.43□□□□□ -1.22
YJL225CP40889 YJR015WYJR015W 1533 nt7.43□□□□□ -1.22
YJL225CP40889 ARP2YDL029W 1176 nt7.43□□□□□ -1.22
YJL225CP40889 YDL034WYDL034W 345 nt7.43□□□□□ -1.22
YJL225CP40889 BBP1YPL255W 1158 nt7.43□□□□□ -1.22
YJL225CP40889 ECM38YLR299W 1983 nt7.42□□□□□ -1.22
YJL225CP40889 VMA16YHR026W 642 nt7.42□□□□□ -1.22
YJL225CP40889 RRN10YBL025W 438 nt7.42□□□□□ -1.22
YJL225CP40889 YNL019CYNL019C 855 nt7.42□□□□□ -1.22
YJL225CP40889 YNL033WYNL033W 855 nt7.42□□□□□ -1.22
YJL225CP40889 GLN1YPR035W 1113 nt7.42□□□□□ -1.22
YJL225CP40889 APS3YJL024C 585 nt7.41□□□□□ -1.22
YJL225CP40889 SHM1YBR263W 1473 nt7.4□□□□□ -1.22
YJL225CP40889 IPI1YHR085W 1005 nt7.4□□□□□ -1.23
YJL225CP40889 YPL062WYPL062W 405 nt7.4□□□□□ -1.23
YJL225CP40889 YMR155WYMR155W 1644 nt7.39□□□□□ -1.23
YJL225CP40889 RQC1YDR333C 2172 nt7.39□□□□□ -1.23
YJL225CP40889 TAL1YLR354C 1008 nt7.38□□□□□ -1.23
YJL225CP40889 SMK1YPR054W 1167 nt7.38□□□□□ -1.23
YJL225CP40889 YGR176WYGR176W 348 nt7.38□□□□□ -1.23
YJL225CP40889 YAL056C-AYAL056C-A 351 nt7.38□□□□□ -1.23
YJL225CP40889 YIL177CYIL177C 5277 nt7.37□□□□□ -1.23
YJL225CP40889 YGR182CYGR182C 354 nt7.37□□□□□ -1.23
YJL225CP40889 tR(ACG)JtR(ACG)J 73 nt7.37□□□□□ -1.23
YJL225CP40889 FRS2YFL022C 1512 nt7.36□□□□□ -1.23
YJL225CP40889 RRP45YDR280W 918 nt7.36□□□□□ -1.23
YJL225CP40889 YER010CYER010C 705 nt7.36□□□□□ -1.23
YJL225CP40889 YBR144CYBR144C 315 nt7.36□□□□□ -1.23
YJL225CP40889 YHL017WYHL017W 1599 nt7.36□□□□□ -1.23
YJL225CP40889 HIS7YBR248C 1659 nt7.36□□□□□ -1.23
YJL225CP40889 YML082WYML082W 1950 nt7.36□□□□□ -1.23
YJL225CP40889 SHE10YGL228W 1734 nt7.36□□□□□ -1.23
YJL225CP40889 HSX1tR(CCU)J 72 nt7.36□□□□□ -1.23
YJL225CP40889 YBR124WYBR124W 360 nt7.36□□□□□ -1.23
YJL225CP40889 GAA1YLR088W 1845 nt7.35□□□□□ -1.23
YJL225CP40889 YCL065WYCL065W 369 nt7.35□□□□□ -1.23
YJL225CP40889 YDR154CYDR154C 351 nt7.34□□□□□ -1.23
YJL225CP40889 DMA1YHR115C 1251 nt7.34□□□□□ -1.23
YJL225CP40889 MOD5YOR274W 1287 nt7.34□□□□□ -1.23
YJL225CP40889 CAD1YDR423C 1230 nt7.33□□□□□ -1.24
YJL225CP40889 YHR127WYHR127W 732 nt7.33□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 16.7 ms