Protein–RNA interactions for Protein: P40550

PDR11, ATP-dependent permease PDR11, yeastyeast

Predictions only

Length 1,411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PDR11P40550 YPR204WYPR204W 3099 nt8.23□□□□□ -1.09
PDR11P40550 YDL114WYDL114W 927 nt8.22□□□□□ -1.09
PDR11P40550 QCR6YFR033C 444 nt8.22□□□□□ -1.09
PDR11P40550 LEU5YHR002W 1074 nt8.21□□□□□ -1.09
PDR11P40550 HSP12YFL014W 330 nt8.2□□□□□ -1.1
PDR11P40550 ARG81YML099C 2643 nt8.2□□□□□ -1.1
PDR11P40550 MDH3YDL078C 1032 nt8.2□□□□□ -1.1
PDR11P40550 YKL031WYKL031W 414 nt8.2□□□□□ -1.1
PDR11P40550 APE3YBR286W 1614 nt8.19□□□□□ -1.1
PDR11P40550 PPS1YBR276C 2424 nt8.19□□□□□ -1.1
PDR11P40550 CRP1YHR146W 1398 nt8.19□□□□□ -1.1
PDR11P40550 GTB1YDR221W 2109 nt8.19□□□□□ -1.1
PDR11P40550 YLR194CYLR194C 765 nt8.19□□□□□ -1.1
PDR11P40550 ERI1YPL096C-A 207 nt8.18□□□□□ -1.1
PDR11P40550 ECM38YLR299W 1983 nt8.17□□□□□ -1.1
PDR11P40550 KKQ8YKL168C 2175 nt8.17□□□□□ -1.1
PDR11P40550 SEC20YDR498C 1152 nt8.17□□□□□ -1.1
PDR11P40550 VMA16YHR026W 642 nt8.17□□□□□ -1.1
PDR11P40550 HSP26YBR072W 645 nt8.17□□□□□ -1.1
PDR11P40550 IME2YJL106W 1938 nt8.16□□□□□ -1.1
PDR11P40550 GTT3YEL017W 1014 nt8.16□□□□□ -1.1
PDR11P40550 tX(XXX)DtX(XXX)D 100 nt8.16□□□□□ -1.1
PDR11P40550 YHM2YMR241W 945 nt8.16□□□□□ -1.1
PDR11P40550 RQC1YDR333C 2172 nt8.16□□□□□ -1.1
PDR11P40550 TEP1YNL128W 1305 nt8.15□□□□□ -1.1
PDR11P40550 YDL057WYDL057W 987 nt8.15□□□□□ -1.1
PDR11P40550 DJP1YIR004W 1299 nt8.15□□□□□ -1.1
PDR11P40550 YOR342CYOR342C 960 nt8.15□□□□□ -1.1
PDR11P40550 YDR109CYDR109C 2148 nt8.15□□□□□ -1.1
PDR11P40550 GIT1YCR098C 1557 nt8.15□□□□□ -1.1
PDR11P40550 CCP1YKR066C 1086 nt8.14□□□□□ -1.11
PDR11P40550 ARR3YPR201W 1215 nt8.14□□□□□ -1.11
PDR11P40550 YDR278CYDR278C 318 nt8.13□□□□□ -1.11
PDR11P40550 ORC5YNL261W 1440 nt8.13□□□□□ -1.11
PDR11P40550 CBP4YGR174C 513 nt8.12□□□□□ -1.11
PDR11P40550 MRPL13YKR006C 795 nt8.12□□□□□ -1.11
PDR11P40550 RPS9AYPL081W 594 nt8.12□□□□□ -1.11
PDR11P40550 PSY4YBL046W 1326 nt8.12□□□□□ -1.11
PDR11P40550 YBR144CYBR144C 315 nt8.12□□□□□ -1.11
PDR11P40550 CNE1YAL058W 1509 nt8.11□□□□□ -1.11
PDR11P40550 ARP2YDL029W 1176 nt8.11□□□□□ -1.11
PDR11P40550 YFL064CYFL064C 525 nt8.11□□□□□ -1.11
PDR11P40550 BCY1YIL033C 1251 nt8.11□□□□□ -1.11
PDR11P40550 SSO1YPL232W 873 nt8.11□□□□□ -1.11
PDR11P40550 YPR202WYPR202W 717 nt8.11□□□□□ -1.11
PDR11P40550 YBR230W-AYBR230W-A 201 nt8.11□□□□□ -1.11
PDR11P40550 RRN10YBL025W 438 nt8.1□□□□□ -1.11
PDR11P40550 SYN8YAL014C 768 nt8.09□□□□□ -1.11
PDR11P40550 SMK1YPR054W 1167 nt8.09□□□□□ -1.11
PDR11P40550 TEA1YOR337W 2280 nt8.09□□□□□ -1.11
PDR11P40550 RTG2YGL252C 1767 nt8.09□□□□□ -1.12
PDR11P40550 AMD1YML035C 2433 nt8.08□□□□□ -1.12
PDR11P40550 KNH1YDL049C 807 nt8.08□□□□□ -1.12
PDR11P40550 RRP45YDR280W 918 nt8.08□□□□□ -1.12
PDR11P40550 APS3YJL024C 585 nt8.08□□□□□ -1.12
PDR11P40550 SFC1YJR095W 969 nt8.07□□□□□ -1.12
PDR11P40550 FRT1YOR324C 1809 nt8.07□□□□□ -1.12
PDR11P40550 SHM1YBR263W 1473 nt8.07□□□□□ -1.12
PDR11P40550 CTF3YLR381W 2202 nt8.07□□□□□ -1.12
PDR11P40550 RPT3YDR394W 1287 nt8.06□□□□□ -1.12
PDR11P40550 GLN1YPR035W 1113 nt8.06□□□□□ -1.12
PDR11P40550 PET112YBL080C 1626 nt8.06□□□□□ -1.12
PDR11P40550 FRS2YFL022C 1512 nt8.06□□□□□ -1.12
PDR11P40550 ATO3YDR384C 828 nt8.05□□□□□ -1.12
PDR11P40550 YLR283WYLR283W 945 nt8.05□□□□□ -1.12
PDR11P40550 GYP8YFL027C 1494 nt8.05□□□□□ -1.12
PDR11P40550 PAN6YIL145C 930 nt8.04□□□□□ -1.12
PDR11P40550 YML083CYML083C 1257 nt8.04□□□□□ -1.12
PDR11P40550 GAL2YLR081W 1725 nt8.04□□□□□ -1.12
PDR11P40550 ADE13YLR359W 1449 nt8.04□□□□□ -1.12
PDR11P40550 CIR2YOR356W 1896 nt8.04□□□□□ -1.12
PDR11P40550 BDF2YDL070W 1917 nt8.04□□□□□ -1.12
PDR11P40550 DMA1YHR115C 1251 nt8.03□□□□□ -1.12
PDR11P40550 Q0182Q0182 405 nt8.03□□□□□ -1.12
PDR11P40550 CAR1YPL111W 1002 nt8.03□□□□□ -1.12
PDR11P40550 MRPL36YBR122C 534 nt8.03□□□□□ -1.12
PDR11P40550 ERG3YLR056W 1098 nt8.02□□□□□ -1.13
PDR11P40550 CSG2YBR036C 1233 nt8.02□□□□□ -1.13
PDR11P40550 YOR389WYOR389W 1875 nt8.01□□□□□ -1.13
PDR11P40550 YMR155WYMR155W 1644 nt8.01□□□□□ -1.13
PDR11P40550 YFR034W-AYFR034W-A 288 nt8□□□□□ -1.13
PDR11P40550 HSM3YBR272C 1443 nt8□□□□□ -1.13
PDR11P40550 tR(ACG)JtR(ACG)J 73 nt7.99□□□□□ -1.13
PDR11P40550 SUP19tS(UGA)E 82 nt7.99□□□□□ -1.13
PDR11P40550 SUP17tS(UGA)I 82 nt7.99□□□□□ -1.13
PDR11P40550 SUP16tS(UGA)P 82 nt7.99□□□□□ -1.13
PDR11P40550 VRP1YLR337C 2454 nt7.98□□□□□ -1.13
PDR11P40550 QNS1YHR074W 2145 nt7.98□□□□□ -1.13
PDR11P40550 YDR154CYDR154C 351 nt7.98□□□□□ -1.13
PDR11P40550 EFM3YJR129C 1020 nt7.98□□□□□ -1.13
PDR11P40550 DPH5YLR172C 903 nt7.98□□□□□ -1.13
PDR11P40550 DUS4YLR405W 1104 nt7.98□□□□□ -1.13
PDR11P40550 YNR042WYNR042W 429 nt7.98□□□□□ -1.13
PDR11P40550 MOD5YOR274W 1287 nt7.98□□□□□ -1.13
PDR11P40550 MLC1YGL106W 450 nt7.97□□□□□ -1.13
PDR11P40550 YNL040WYNL040W 1371 nt7.96□□□□□ -1.13
PDR11P40550 YCL065WYCL065W 369 nt7.96□□□□□ -1.13
PDR11P40550 YRA1YDR381W 681 nt7.96□□□□□ -1.13
PDR11P40550 PRP46YPL151C 1356 nt7.96□□□□□ -1.14
PDR11P40550 GLE1YDL207W 1617 nt7.95□□□□□ -1.14
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