Protein–RNA interactions for Protein: P38646

HSPA9, Stress-70 protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 679 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPA9P38646 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HSPA9P38646 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HSPA9P38646 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HSPA9P38646 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HSPA9P38646 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HSPA9P38646 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HSPA9P38646 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HSPA9P38646 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HSPA9P38646 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HSPA9P38646 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HSPA9P38646 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HSPA9P38646 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HSPA9P38646 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HSPA9P38646 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HSPA9P38646 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HSPA9P38646 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HSPA9P38646 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HSPA9P38646 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HSPA9P38646 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HSPA9P38646 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
HSPA9P38646 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HSPA9P38646 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HSPA9P38646 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HSPA9P38646 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HSPA9P38646 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HSPA9P38646 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HSPA9P38646 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
HSPA9P38646 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
HSPA9P38646 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
HSPA9P38646 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
HSPA9P38646 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
HSPA9P38646 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
HSPA9P38646 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
HSPA9P38646 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HSPA9P38646 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HSPA9P38646 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HSPA9P38646 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HSPA9P38646 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
HSPA9P38646 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HSPA9P38646 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HSPA9P38646 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HSPA9P38646 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HSPA9P38646 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HSPA9P38646 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HSPA9P38646 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HSPA9P38646 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
HSPA9P38646 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HSPA9P38646 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HSPA9P38646 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
HSPA9P38646 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HSPA9P38646 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HSPA9P38646 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HSPA9P38646 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HSPA9P38646 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HSPA9P38646 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HSPA9P38646 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HSPA9P38646 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HSPA9P38646 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HSPA9P38646 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HSPA9P38646 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HSPA9P38646 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HSPA9P38646 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HSPA9P38646 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HSPA9P38646 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
HSPA9P38646 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HSPA9P38646 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HSPA9P38646 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HSPA9P38646 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HSPA9P38646 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
HSPA9P38646 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
HSPA9P38646 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
HSPA9P38646 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HSPA9P38646 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HSPA9P38646 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
HSPA9P38646 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HSPA9P38646 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
HSPA9P38646 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HSPA9P38646 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HSPA9P38646 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HSPA9P38646 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HSPA9P38646 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HSPA9P38646 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HSPA9P38646 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HSPA9P38646 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HSPA9P38646 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
HSPA9P38646 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HSPA9P38646 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HSPA9P38646 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HSPA9P38646 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HSPA9P38646 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HSPA9P38646 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HSPA9P38646 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HSPA9P38646 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HSPA9P38646 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HSPA9P38646 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HSPA9P38646 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HSPA9P38646 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HSPA9P38646 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HSPA9P38646 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
HSPA9P38646 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms