Protein–RNA interactions for Protein: P35663

CYLC1, Cylicin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYLC1P35663 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CYLC1P35663 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CYLC1P35663 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CYLC1P35663 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CYLC1P35663 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CYLC1P35663 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CYLC1P35663 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CYLC1P35663 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CYLC1P35663 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CYLC1P35663 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CYLC1P35663 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CYLC1P35663 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CYLC1P35663 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CYLC1P35663 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CYLC1P35663 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CYLC1P35663 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
CYLC1P35663 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
CYLC1P35663 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
CYLC1P35663 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CYLC1P35663 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CYLC1P35663 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CYLC1P35663 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
CYLC1P35663 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CYLC1P35663 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CYLC1P35663 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CYLC1P35663 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CYLC1P35663 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CYLC1P35663 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CYLC1P35663 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CYLC1P35663 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CYLC1P35663 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CYLC1P35663 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CYLC1P35663 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CYLC1P35663 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CYLC1P35663 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CYLC1P35663 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
CYLC1P35663 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CYLC1P35663 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CYLC1P35663 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CYLC1P35663 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
CYLC1P35663 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CYLC1P35663 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CYLC1P35663 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CYLC1P35663 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CYLC1P35663 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CYLC1P35663 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CYLC1P35663 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CYLC1P35663 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CYLC1P35663 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CYLC1P35663 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CYLC1P35663 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CYLC1P35663 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CYLC1P35663 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CYLC1P35663 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CYLC1P35663 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CYLC1P35663 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CYLC1P35663 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CYLC1P35663 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CYLC1P35663 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CYLC1P35663 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CYLC1P35663 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CYLC1P35663 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CYLC1P35663 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CYLC1P35663 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CYLC1P35663 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CYLC1P35663 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CYLC1P35663 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CYLC1P35663 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CYLC1P35663 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CYLC1P35663 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CYLC1P35663 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CYLC1P35663 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CYLC1P35663 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CYLC1P35663 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CYLC1P35663 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CYLC1P35663 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CYLC1P35663 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CYLC1P35663 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CYLC1P35663 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CYLC1P35663 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CYLC1P35663 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CYLC1P35663 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
CYLC1P35663 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CYLC1P35663 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CYLC1P35663 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CYLC1P35663 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CYLC1P35663 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CYLC1P35663 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CYLC1P35663 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CYLC1P35663 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CYLC1P35663 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CYLC1P35663 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CYLC1P35663 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CYLC1P35663 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CYLC1P35663 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CYLC1P35663 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CYLC1P35663 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CYLC1P35663 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CYLC1P35663 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CYLC1P35663 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms