Protein–RNA interactions for Protein: P29536

LMOD1, Leiomodin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 600 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMOD1P29536 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC29.44■■■□□ 2.3
LMOD1P29536 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
LMOD1P29536 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
LMOD1P29536 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
LMOD1P29536 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
LMOD1P29536 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
LMOD1P29536 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC29.43■■■□□ 2.3
LMOD1P29536 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
LMOD1P29536 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
LMOD1P29536 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
LMOD1P29536 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
LMOD1P29536 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
LMOD1P29536 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
LMOD1P29536 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
LMOD1P29536 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
LMOD1P29536 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
LMOD1P29536 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
LMOD1P29536 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
LMOD1P29536 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
LMOD1P29536 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
LMOD1P29536 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC29.41■■■□□ 2.3
LMOD1P29536 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
LMOD1P29536 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
LMOD1P29536 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
LMOD1P29536 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
LMOD1P29536 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
LMOD1P29536 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
LMOD1P29536 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
LMOD1P29536 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
LMOD1P29536 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
LMOD1P29536 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
LMOD1P29536 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
LMOD1P29536 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
LMOD1P29536 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
LMOD1P29536 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
LMOD1P29536 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
LMOD1P29536 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
LMOD1P29536 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
LMOD1P29536 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.29
LMOD1P29536 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
LMOD1P29536 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC29.38■■■□□ 2.29
LMOD1P29536 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC29.38■■■□□ 2.29
LMOD1P29536 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
LMOD1P29536 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
LMOD1P29536 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC29.38■■■□□ 2.29
LMOD1P29536 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
LMOD1P29536 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
LMOD1P29536 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
LMOD1P29536 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
LMOD1P29536 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
LMOD1P29536 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
LMOD1P29536 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
LMOD1P29536 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
LMOD1P29536 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
LMOD1P29536 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
LMOD1P29536 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
LMOD1P29536 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
LMOD1P29536 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
LMOD1P29536 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
LMOD1P29536 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
LMOD1P29536 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
LMOD1P29536 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
LMOD1P29536 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
LMOD1P29536 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
LMOD1P29536 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
LMOD1P29536 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
LMOD1P29536 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
LMOD1P29536 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
LMOD1P29536 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC29.34■■■□□ 2.29
LMOD1P29536 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
LMOD1P29536 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
LMOD1P29536 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
LMOD1P29536 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC29.33■■■□□ 2.29
LMOD1P29536 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
LMOD1P29536 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
LMOD1P29536 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
LMOD1P29536 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
LMOD1P29536 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
LMOD1P29536 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
LMOD1P29536 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
LMOD1P29536 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
LMOD1P29536 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
LMOD1P29536 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
LMOD1P29536 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
LMOD1P29536 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC29.31■■■□□ 2.28
LMOD1P29536 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC29.31■■■□□ 2.28
LMOD1P29536 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
LMOD1P29536 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
LMOD1P29536 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
LMOD1P29536 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
LMOD1P29536 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
LMOD1P29536 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
LMOD1P29536 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
LMOD1P29536 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
LMOD1P29536 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
LMOD1P29536 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
LMOD1P29536 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
LMOD1P29536 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC29.29■■■□□ 2.28
LMOD1P29536 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
LMOD1P29536 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms