Protein–RNA interactions for Protein: P29508

SERPINB3, Serpin B3, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPINB3P29508 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SERPINB3P29508 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SERPINB3P29508 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SERPINB3P29508 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SERPINB3P29508 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SERPINB3P29508 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SERPINB3P29508 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SERPINB3P29508 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SERPINB3P29508 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SERPINB3P29508 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SERPINB3P29508 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SERPINB3P29508 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SERPINB3P29508 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SERPINB3P29508 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SERPINB3P29508 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SERPINB3P29508 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SERPINB3P29508 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SERPINB3P29508 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SERPINB3P29508 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SERPINB3P29508 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SERPINB3P29508 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SERPINB3P29508 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SERPINB3P29508 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SERPINB3P29508 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SERPINB3P29508 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SERPINB3P29508 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SERPINB3P29508 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SERPINB3P29508 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SERPINB3P29508 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SERPINB3P29508 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SERPINB3P29508 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SERPINB3P29508 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SERPINB3P29508 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SERPINB3P29508 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SERPINB3P29508 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SERPINB3P29508 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
SERPINB3P29508 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SERPINB3P29508 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SERPINB3P29508 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SERPINB3P29508 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SERPINB3P29508 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SERPINB3P29508 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SERPINB3P29508 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SERPINB3P29508 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SERPINB3P29508 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SERPINB3P29508 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SERPINB3P29508 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SERPINB3P29508 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SERPINB3P29508 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SERPINB3P29508 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SERPINB3P29508 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SERPINB3P29508 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SERPINB3P29508 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SERPINB3P29508 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SERPINB3P29508 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SERPINB3P29508 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SERPINB3P29508 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SERPINB3P29508 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SERPINB3P29508 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SERPINB3P29508 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SERPINB3P29508 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SERPINB3P29508 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SERPINB3P29508 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SERPINB3P29508 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SERPINB3P29508 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SERPINB3P29508 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SERPINB3P29508 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SERPINB3P29508 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SERPINB3P29508 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SERPINB3P29508 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SERPINB3P29508 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SERPINB3P29508 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SERPINB3P29508 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SERPINB3P29508 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SERPINB3P29508 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SERPINB3P29508 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SERPINB3P29508 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SERPINB3P29508 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SERPINB3P29508 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SERPINB3P29508 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SERPINB3P29508 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SERPINB3P29508 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SERPINB3P29508 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SERPINB3P29508 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SERPINB3P29508 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SERPINB3P29508 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SERPINB3P29508 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SERPINB3P29508 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SERPINB3P29508 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SERPINB3P29508 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
SERPINB3P29508 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
SERPINB3P29508 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SERPINB3P29508 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SERPINB3P29508 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SERPINB3P29508 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SERPINB3P29508 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SERPINB3P29508 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SERPINB3P29508 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SERPINB3P29508 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SERPINB3P29508 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms