Protein–RNA interactions for Protein: P28908

TNFRSF8, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 8, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF8P28908 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
TNFRSF8P28908 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TNFRSF8P28908 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TNFRSF8P28908 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TNFRSF8P28908 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TNFRSF8P28908 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TNFRSF8P28908 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TNFRSF8P28908 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TNFRSF8P28908 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TNFRSF8P28908 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TNFRSF8P28908 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TNFRSF8P28908 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TNFRSF8P28908 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TNFRSF8P28908 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TNFRSF8P28908 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TNFRSF8P28908 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TNFRSF8P28908 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TNFRSF8P28908 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TNFRSF8P28908 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TNFRSF8P28908 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TNFRSF8P28908 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TNFRSF8P28908 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TNFRSF8P28908 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TNFRSF8P28908 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TNFRSF8P28908 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TNFRSF8P28908 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TNFRSF8P28908 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TNFRSF8P28908 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TNFRSF8P28908 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TNFRSF8P28908 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
TNFRSF8P28908 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TNFRSF8P28908 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TNFRSF8P28908 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TNFRSF8P28908 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TNFRSF8P28908 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TNFRSF8P28908 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TNFRSF8P28908 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TNFRSF8P28908 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TNFRSF8P28908 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
TNFRSF8P28908 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TNFRSF8P28908 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
TNFRSF8P28908 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TNFRSF8P28908 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TNFRSF8P28908 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TNFRSF8P28908 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TNFRSF8P28908 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TNFRSF8P28908 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TNFRSF8P28908 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TNFRSF8P28908 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TNFRSF8P28908 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TNFRSF8P28908 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TNFRSF8P28908 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TNFRSF8P28908 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TNFRSF8P28908 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TNFRSF8P28908 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TNFRSF8P28908 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TNFRSF8P28908 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TNFRSF8P28908 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TNFRSF8P28908 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TNFRSF8P28908 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TNFRSF8P28908 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
TNFRSF8P28908 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TNFRSF8P28908 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TNFRSF8P28908 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TNFRSF8P28908 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TNFRSF8P28908 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TNFRSF8P28908 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TNFRSF8P28908 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TNFRSF8P28908 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TNFRSF8P28908 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TNFRSF8P28908 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TNFRSF8P28908 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TNFRSF8P28908 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TNFRSF8P28908 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TNFRSF8P28908 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TNFRSF8P28908 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TNFRSF8P28908 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TNFRSF8P28908 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TNFRSF8P28908 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TNFRSF8P28908 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TNFRSF8P28908 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TNFRSF8P28908 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TNFRSF8P28908 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
TNFRSF8P28908 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TNFRSF8P28908 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TNFRSF8P28908 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TNFRSF8P28908 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TNFRSF8P28908 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TNFRSF8P28908 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TNFRSF8P28908 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TNFRSF8P28908 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TNFRSF8P28908 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TNFRSF8P28908 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TNFRSF8P28908 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TNFRSF8P28908 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TNFRSF8P28908 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TNFRSF8P28908 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TNFRSF8P28908 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TNFRSF8P28908 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TNFRSF8P28908 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms