Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC36.16■■■■□ 3.38
PTPRMP28827 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC36.16■■■■□ 3.38
PTPRMP28827 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
PTPRMP28827 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
PTPRMP28827 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
PTPRMP28827 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC36.14■■■■□ 3.38
PTPRMP28827 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
PTPRMP28827 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC36.14■■■■□ 3.38
PTPRMP28827 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.14■■■■□ 3.38
PTPRMP28827 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
PTPRMP28827 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
PTPRMP28827 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC36.13■■■■□ 3.37
PTPRMP28827 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
PTPRMP28827 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.12■■■■□ 3.37
PTPRMP28827 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC36.12■■■■□ 3.37
PTPRMP28827 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC36.12■■■■□ 3.37
PTPRMP28827 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC36.12■■■■□ 3.37
PTPRMP28827 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
PTPRMP28827 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC36.11■■■■□ 3.37
PTPRMP28827 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC36.11■■■■□ 3.37
PTPRMP28827 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
PTPRMP28827 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
PTPRMP28827 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC36.11■■■■□ 3.37
PTPRMP28827 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
PTPRMP28827 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
PTPRMP28827 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
PTPRMP28827 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
PTPRMP28827 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
PTPRMP28827 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC36.1■■■■□ 3.37
PTPRMP28827 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
PTPRMP28827 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.1■■■■□ 3.37
PTPRMP28827 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC36.1■■■■□ 3.37
PTPRMP28827 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC36.1■■■■□ 3.37
PTPRMP28827 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
PTPRMP28827 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
PTPRMP28827 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.37
PTPRMP28827 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC36.07■■■■□ 3.37
PTPRMP28827 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC36.07■■■■□ 3.36
PTPRMP28827 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC36.06■■■■□ 3.36
PTPRMP28827 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.06■■■■□ 3.36
PTPRMP28827 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC36.06■■■■□ 3.36
PTPRMP28827 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC36.05■■■■□ 3.36
PTPRMP28827 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.05■■■■□ 3.36
PTPRMP28827 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
PTPRMP28827 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
PTPRMP28827 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC36.05■■■■□ 3.36
PTPRMP28827 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC36.05■■■■□ 3.36
PTPRMP28827 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
PTPRMP28827 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.04■■■■□ 3.36
PTPRMP28827 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
PTPRMP28827 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC36.04■■■■□ 3.36
PTPRMP28827 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
PTPRMP28827 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC36.03■■■■□ 3.36
PTPRMP28827 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC36.02■■■■□ 3.36
PTPRMP28827 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC36.02■■■■□ 3.36
PTPRMP28827 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC36.02■■■■□ 3.36
PTPRMP28827 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC36.01■■■■□ 3.36
PTPRMP28827 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC36.01■■■■□ 3.36
PTPRMP28827 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC36.01■■■■□ 3.36
PTPRMP28827 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.01■■■■□ 3.36
PTPRMP28827 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC36.01■■■■□ 3.36
PTPRMP28827 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC36■■■■□ 3.35
PTPRMP28827 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC36■■■■□ 3.35
PTPRMP28827 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC36■■■■□ 3.35
PTPRMP28827 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC35.99■■■■□ 3.35
PTPRMP28827 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC35.99■■■■□ 3.35
PTPRMP28827 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
PTPRMP28827 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC35.99■■■■□ 3.35
PTPRMP28827 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC35.99■■■■□ 3.35
PTPRMP28827 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
PTPRMP28827 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.98■■■■□ 3.35
PTPRMP28827 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC35.98■■■■□ 3.35
PTPRMP28827 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.97■■■■□ 3.35
PTPRMP28827 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC35.97■■■■□ 3.35
PTPRMP28827 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC35.97■■■■□ 3.35
PTPRMP28827 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC35.97■■■■□ 3.35
PTPRMP28827 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
PTPRMP28827 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
PTPRMP28827 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
PTPRMP28827 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
PTPRMP28827 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
PTPRMP28827 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
PTPRMP28827 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
PTPRMP28827 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
PTPRMP28827 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC35.94■■■■□ 3.34
PTPRMP28827 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC35.93■■■■□ 3.34
PTPRMP28827 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
PTPRMP28827 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
PTPRMP28827 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC35.93■■■■□ 3.34
PTPRMP28827 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC35.93■■■■□ 3.34
PTPRMP28827 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
PTPRMP28827 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC35.92■■■■□ 3.34
PTPRMP28827 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC35.92■■■■□ 3.34
PTPRMP28827 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC35.92■■■■□ 3.34
PTPRMP28827 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
PTPRMP28827 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC35.92■■■■□ 3.34
PTPRMP28827 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.92■■■■□ 3.34
PTPRMP28827 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC35.92■■■■□ 3.34
PTPRMP28827 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC35.91■■■■□ 3.34
PTPRMP28827 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
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