Protein–RNA interactions for Protein: P23921

RRM1, Ribonucleoside-diphosphate reductase large subunit, humanhuman

Predictions only

Length 792 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRM1P23921 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
RRM1P23921 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
RRM1P23921 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RRM1P23921 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RRM1P23921 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RRM1P23921 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
RRM1P23921 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RRM1P23921 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RRM1P23921 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RRM1P23921 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RRM1P23921 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RRM1P23921 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RRM1P23921 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RRM1P23921 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RRM1P23921 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RRM1P23921 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RRM1P23921 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RRM1P23921 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RRM1P23921 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
RRM1P23921 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RRM1P23921 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RRM1P23921 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RRM1P23921 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RRM1P23921 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RRM1P23921 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
RRM1P23921 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RRM1P23921 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RRM1P23921 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RRM1P23921 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RRM1P23921 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RRM1P23921 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RRM1P23921 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RRM1P23921 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RRM1P23921 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RRM1P23921 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
RRM1P23921 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
RRM1P23921 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RRM1P23921 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RRM1P23921 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RRM1P23921 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RRM1P23921 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RRM1P23921 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RRM1P23921 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RRM1P23921 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RRM1P23921 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RRM1P23921 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RRM1P23921 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RRM1P23921 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RRM1P23921 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RRM1P23921 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RRM1P23921 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RRM1P23921 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RRM1P23921 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RRM1P23921 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RRM1P23921 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RRM1P23921 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RRM1P23921 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
RRM1P23921 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RRM1P23921 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RRM1P23921 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RRM1P23921 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RRM1P23921 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RRM1P23921 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RRM1P23921 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RRM1P23921 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RRM1P23921 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RRM1P23921 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RRM1P23921 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RRM1P23921 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
RRM1P23921 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RRM1P23921 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RRM1P23921 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RRM1P23921 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RRM1P23921 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RRM1P23921 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RRM1P23921 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
RRM1P23921 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RRM1P23921 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RRM1P23921 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RRM1P23921 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RRM1P23921 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RRM1P23921 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RRM1P23921 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RRM1P23921 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RRM1P23921 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RRM1P23921 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RRM1P23921 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RRM1P23921 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RRM1P23921 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RRM1P23921 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RRM1P23921 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RRM1P23921 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RRM1P23921 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RRM1P23921 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RRM1P23921 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RRM1P23921 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RRM1P23921 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RRM1P23921 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RRM1P23921 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RRM1P23921 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms