Protein–RNA interactions for Protein: P20336

RAB3A, Ras-related protein Rab-3A, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3AP20336 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
RAB3AP20336 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RAB3AP20336 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RAB3AP20336 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RAB3AP20336 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RAB3AP20336 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RAB3AP20336 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
RAB3AP20336 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
RAB3AP20336 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
RAB3AP20336 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
RAB3AP20336 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
RAB3AP20336 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RAB3AP20336 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RAB3AP20336 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RAB3AP20336 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RAB3AP20336 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RAB3AP20336 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RAB3AP20336 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RAB3AP20336 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RAB3AP20336 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RAB3AP20336 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RAB3AP20336 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RAB3AP20336 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RAB3AP20336 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RAB3AP20336 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RAB3AP20336 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RAB3AP20336 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RAB3AP20336 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RAB3AP20336 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RAB3AP20336 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RAB3AP20336 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RAB3AP20336 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RAB3AP20336 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RAB3AP20336 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RAB3AP20336 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RAB3AP20336 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RAB3AP20336 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RAB3AP20336 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RAB3AP20336 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RAB3AP20336 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RAB3AP20336 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RAB3AP20336 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RAB3AP20336 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
RAB3AP20336 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RAB3AP20336 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RAB3AP20336 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RAB3AP20336 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RAB3AP20336 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RAB3AP20336 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RAB3AP20336 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
RAB3AP20336 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RAB3AP20336 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RAB3AP20336 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
RAB3AP20336 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RAB3AP20336 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
RAB3AP20336 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RAB3AP20336 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RAB3AP20336 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RAB3AP20336 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RAB3AP20336 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RAB3AP20336 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RAB3AP20336 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RAB3AP20336 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RAB3AP20336 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RAB3AP20336 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RAB3AP20336 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RAB3AP20336 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RAB3AP20336 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RAB3AP20336 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
RAB3AP20336 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RAB3AP20336 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
RAB3AP20336 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
RAB3AP20336 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
RAB3AP20336 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RAB3AP20336 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RAB3AP20336 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RAB3AP20336 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RAB3AP20336 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RAB3AP20336 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
RAB3AP20336 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RAB3AP20336 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RAB3AP20336 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
RAB3AP20336 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RAB3AP20336 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
RAB3AP20336 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RAB3AP20336 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RAB3AP20336 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RAB3AP20336 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RAB3AP20336 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RAB3AP20336 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RAB3AP20336 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RAB3AP20336 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RAB3AP20336 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RAB3AP20336 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
RAB3AP20336 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RAB3AP20336 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RAB3AP20336 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
RAB3AP20336 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RAB3AP20336 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
RAB3AP20336 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms