Protein–RNA interactions for Protein: P18545

PDE6G, Retinal rod rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit gamma, humanhuman

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Length 87 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6GP18545 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
PDE6GP18545 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PDE6GP18545 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PDE6GP18545 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PDE6GP18545 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PDE6GP18545 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PDE6GP18545 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PDE6GP18545 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PDE6GP18545 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PDE6GP18545 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PDE6GP18545 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PDE6GP18545 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PDE6GP18545 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
PDE6GP18545 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PDE6GP18545 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PDE6GP18545 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PDE6GP18545 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PDE6GP18545 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PDE6GP18545 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PDE6GP18545 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PDE6GP18545 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PDE6GP18545 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PDE6GP18545 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PDE6GP18545 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PDE6GP18545 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PDE6GP18545 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PDE6GP18545 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PDE6GP18545 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PDE6GP18545 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PDE6GP18545 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PDE6GP18545 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PDE6GP18545 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PDE6GP18545 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PDE6GP18545 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PDE6GP18545 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PDE6GP18545 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PDE6GP18545 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PDE6GP18545 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PDE6GP18545 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PDE6GP18545 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PDE6GP18545 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PDE6GP18545 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PDE6GP18545 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PDE6GP18545 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PDE6GP18545 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PDE6GP18545 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PDE6GP18545 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PDE6GP18545 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PDE6GP18545 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PDE6GP18545 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PDE6GP18545 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
PDE6GP18545 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PDE6GP18545 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PDE6GP18545 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PDE6GP18545 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PDE6GP18545 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PDE6GP18545 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PDE6GP18545 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PDE6GP18545 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PDE6GP18545 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PDE6GP18545 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PDE6GP18545 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PDE6GP18545 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PDE6GP18545 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PDE6GP18545 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PDE6GP18545 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PDE6GP18545 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PDE6GP18545 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PDE6GP18545 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PDE6GP18545 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
PDE6GP18545 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PDE6GP18545 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PDE6GP18545 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PDE6GP18545 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PDE6GP18545 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
PDE6GP18545 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
PDE6GP18545 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
PDE6GP18545 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
PDE6GP18545 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PDE6GP18545 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PDE6GP18545 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PDE6GP18545 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PDE6GP18545 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PDE6GP18545 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PDE6GP18545 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PDE6GP18545 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PDE6GP18545 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PDE6GP18545 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PDE6GP18545 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PDE6GP18545 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PDE6GP18545 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PDE6GP18545 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PDE6GP18545 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PDE6GP18545 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
PDE6GP18545 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PDE6GP18545 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PDE6GP18545 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PDE6GP18545 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PDE6GP18545 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
PDE6GP18545 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
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