Protein–RNA interactions for Protein: P17036

ZNF3, Zinc finger protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF3P17036 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNF3P17036 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZNF3P17036 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZNF3P17036 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZNF3P17036 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZNF3P17036 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZNF3P17036 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ZNF3P17036 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ZNF3P17036 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ZNF3P17036 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ZNF3P17036 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ZNF3P17036 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNF3P17036 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNF3P17036 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNF3P17036 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNF3P17036 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNF3P17036 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNF3P17036 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNF3P17036 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNF3P17036 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZNF3P17036 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZNF3P17036 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZNF3P17036 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZNF3P17036 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZNF3P17036 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZNF3P17036 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZNF3P17036 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZNF3P17036 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZNF3P17036 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZNF3P17036 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZNF3P17036 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZNF3P17036 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZNF3P17036 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZNF3P17036 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZNF3P17036 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZNF3P17036 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZNF3P17036 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZNF3P17036 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZNF3P17036 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZNF3P17036 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZNF3P17036 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZNF3P17036 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZNF3P17036 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
ZNF3P17036 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZNF3P17036 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZNF3P17036 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
ZNF3P17036 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZNF3P17036 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZNF3P17036 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZNF3P17036 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZNF3P17036 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZNF3P17036 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZNF3P17036 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZNF3P17036 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZNF3P17036 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZNF3P17036 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZNF3P17036 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZNF3P17036 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZNF3P17036 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZNF3P17036 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZNF3P17036 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZNF3P17036 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZNF3P17036 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZNF3P17036 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZNF3P17036 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZNF3P17036 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZNF3P17036 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZNF3P17036 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZNF3P17036 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZNF3P17036 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNF3P17036 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNF3P17036 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNF3P17036 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNF3P17036 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNF3P17036 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNF3P17036 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNF3P17036 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNF3P17036 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNF3P17036 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNF3P17036 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNF3P17036 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNF3P17036 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNF3P17036 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNF3P17036 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNF3P17036 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNF3P17036 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNF3P17036 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNF3P17036 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNF3P17036 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNF3P17036 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNF3P17036 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNF3P17036 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNF3P17036 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNF3P17036 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.03
ZNF3P17036 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
ZNF3P17036 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZNF3P17036 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZNF3P17036 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZNF3P17036 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZNF3P17036 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms