Protein–RNA interactions for Protein: P15374

UCHL3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase isozyme L3, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UCHL3P15374 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
UCHL3P15374 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
UCHL3P15374 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
UCHL3P15374 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
UCHL3P15374 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
UCHL3P15374 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
UCHL3P15374 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
UCHL3P15374 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
UCHL3P15374 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
UCHL3P15374 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
UCHL3P15374 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
UCHL3P15374 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
UCHL3P15374 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
UCHL3P15374 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
UCHL3P15374 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
UCHL3P15374 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
UCHL3P15374 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
UCHL3P15374 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
UCHL3P15374 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
UCHL3P15374 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
UCHL3P15374 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
UCHL3P15374 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
UCHL3P15374 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
UCHL3P15374 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
UCHL3P15374 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.91■■□□□ 1.74
UCHL3P15374 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
UCHL3P15374 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
UCHL3P15374 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
UCHL3P15374 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
UCHL3P15374 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
UCHL3P15374 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
UCHL3P15374 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
UCHL3P15374 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
UCHL3P15374 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
UCHL3P15374 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
UCHL3P15374 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
UCHL3P15374 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
UCHL3P15374 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
UCHL3P15374 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
UCHL3P15374 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
UCHL3P15374 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
UCHL3P15374 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
UCHL3P15374 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
UCHL3P15374 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
UCHL3P15374 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
UCHL3P15374 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
UCHL3P15374 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
UCHL3P15374 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
UCHL3P15374 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
UCHL3P15374 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
UCHL3P15374 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
UCHL3P15374 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
UCHL3P15374 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
UCHL3P15374 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
UCHL3P15374 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
UCHL3P15374 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
UCHL3P15374 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
UCHL3P15374 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
UCHL3P15374 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
UCHL3P15374 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
UCHL3P15374 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
UCHL3P15374 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
UCHL3P15374 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
UCHL3P15374 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
UCHL3P15374 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
UCHL3P15374 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
UCHL3P15374 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
UCHL3P15374 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
UCHL3P15374 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
UCHL3P15374 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
UCHL3P15374 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
UCHL3P15374 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
UCHL3P15374 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
UCHL3P15374 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
UCHL3P15374 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
UCHL3P15374 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
UCHL3P15374 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
UCHL3P15374 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
UCHL3P15374 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
UCHL3P15374 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
UCHL3P15374 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
UCHL3P15374 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
UCHL3P15374 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
UCHL3P15374 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
UCHL3P15374 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
UCHL3P15374 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
UCHL3P15374 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
UCHL3P15374 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
UCHL3P15374 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
UCHL3P15374 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
UCHL3P15374 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
UCHL3P15374 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
UCHL3P15374 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
UCHL3P15374 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
UCHL3P15374 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
UCHL3P15374 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
UCHL3P15374 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
UCHL3P15374 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
UCHL3P15374 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
UCHL3P15374 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.6 ms