Protein–RNA interactions for Protein: P14543

NID1, Nidogen-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NID1P14543 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NID1P14543 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NID1P14543 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NID1P14543 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NID1P14543 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NID1P14543 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NID1P14543 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NID1P14543 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NID1P14543 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NID1P14543 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NID1P14543 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NID1P14543 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NID1P14543 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NID1P14543 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NID1P14543 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NID1P14543 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
NID1P14543 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NID1P14543 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NID1P14543 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
NID1P14543 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NID1P14543 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NID1P14543 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NID1P14543 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NID1P14543 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NID1P14543 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NID1P14543 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NID1P14543 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NID1P14543 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NID1P14543 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NID1P14543 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NID1P14543 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NID1P14543 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NID1P14543 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NID1P14543 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NID1P14543 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NID1P14543 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NID1P14543 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NID1P14543 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NID1P14543 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NID1P14543 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NID1P14543 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NID1P14543 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NID1P14543 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NID1P14543 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NID1P14543 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NID1P14543 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NID1P14543 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NID1P14543 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NID1P14543 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NID1P14543 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NID1P14543 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NID1P14543 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NID1P14543 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
NID1P14543 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NID1P14543 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NID1P14543 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NID1P14543 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NID1P14543 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NID1P14543 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NID1P14543 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NID1P14543 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NID1P14543 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NID1P14543 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NID1P14543 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NID1P14543 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NID1P14543 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NID1P14543 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NID1P14543 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NID1P14543 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NID1P14543 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NID1P14543 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NID1P14543 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NID1P14543 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NID1P14543 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NID1P14543 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NID1P14543 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NID1P14543 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NID1P14543 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NID1P14543 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NID1P14543 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
NID1P14543 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
NID1P14543 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NID1P14543 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NID1P14543 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NID1P14543 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
NID1P14543 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NID1P14543 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NID1P14543 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NID1P14543 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
NID1P14543 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NID1P14543 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NID1P14543 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
NID1P14543 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NID1P14543 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NID1P14543 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NID1P14543 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NID1P14543 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
NID1P14543 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NID1P14543 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NID1P14543 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms