Protein–RNA interactions for Protein: P14222

PRF1, Perforin-1, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRF1P14222 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PRF1P14222 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PRF1P14222 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PRF1P14222 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRF1P14222 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRF1P14222 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRF1P14222 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRF1P14222 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRF1P14222 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRF1P14222 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRF1P14222 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRF1P14222 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRF1P14222 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRF1P14222 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRF1P14222 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRF1P14222 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRF1P14222 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRF1P14222 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRF1P14222 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRF1P14222 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRF1P14222 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRF1P14222 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRF1P14222 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRF1P14222 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRF1P14222 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRF1P14222 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRF1P14222 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRF1P14222 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRF1P14222 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRF1P14222 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRF1P14222 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRF1P14222 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRF1P14222 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRF1P14222 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRF1P14222 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRF1P14222 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PRF1P14222 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PRF1P14222 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PRF1P14222 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRF1P14222 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRF1P14222 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRF1P14222 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PRF1P14222 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PRF1P14222 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRF1P14222 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRF1P14222 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRF1P14222 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRF1P14222 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRF1P14222 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRF1P14222 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRF1P14222 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRF1P14222 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRF1P14222 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRF1P14222 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRF1P14222 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRF1P14222 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRF1P14222 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRF1P14222 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRF1P14222 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRF1P14222 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRF1P14222 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRF1P14222 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRF1P14222 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRF1P14222 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRF1P14222 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRF1P14222 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRF1P14222 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRF1P14222 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRF1P14222 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRF1P14222 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRF1P14222 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRF1P14222 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRF1P14222 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRF1P14222 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PRF1P14222 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRF1P14222 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRF1P14222 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRF1P14222 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRF1P14222 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRF1P14222 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRF1P14222 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRF1P14222 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRF1P14222 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRF1P14222 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRF1P14222 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRF1P14222 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRF1P14222 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRF1P14222 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRF1P14222 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRF1P14222 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRF1P14222 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRF1P14222 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRF1P14222 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRF1P14222 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRF1P14222 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRF1P14222 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRF1P14222 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRF1P14222 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRF1P14222 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRF1P14222 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms