Protein–RNA interactions for Protein: P12271

RLBP1, Retinaldehyde-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLBP1P12271 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
RLBP1P12271 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
RLBP1P12271 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
RLBP1P12271 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
RLBP1P12271 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC30.62■■■□□ 2.49
RLBP1P12271 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
RLBP1P12271 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
RLBP1P12271 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC30.61■■■□□ 2.49
RLBP1P12271 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
RLBP1P12271 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
RLBP1P12271 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
RLBP1P12271 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
RLBP1P12271 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
RLBP1P12271 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
RLBP1P12271 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC30.59■■■□□ 2.49
RLBP1P12271 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC30.59■■■□□ 2.49
RLBP1P12271 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC30.59■■■□□ 2.49
RLBP1P12271 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
RLBP1P12271 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
RLBP1P12271 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
RLBP1P12271 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
RLBP1P12271 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
RLBP1P12271 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
RLBP1P12271 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
RLBP1P12271 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
RLBP1P12271 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
RLBP1P12271 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
RLBP1P12271 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
RLBP1P12271 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
RLBP1P12271 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
RLBP1P12271 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
RLBP1P12271 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
RLBP1P12271 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
RLBP1P12271 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
RLBP1P12271 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
RLBP1P12271 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC30.55■■■□□ 2.48
RLBP1P12271 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
RLBP1P12271 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
RLBP1P12271 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
RLBP1P12271 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
RLBP1P12271 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
RLBP1P12271 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
RLBP1P12271 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
RLBP1P12271 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
RLBP1P12271 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
RLBP1P12271 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
RLBP1P12271 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
RLBP1P12271 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
RLBP1P12271 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
RLBP1P12271 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
RLBP1P12271 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
RLBP1P12271 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
RLBP1P12271 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC30.52■■■□□ 2.48
RLBP1P12271 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
RLBP1P12271 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
RLBP1P12271 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
RLBP1P12271 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
RLBP1P12271 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.48
RLBP1P12271 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
RLBP1P12271 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
RLBP1P12271 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
RLBP1P12271 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
RLBP1P12271 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
RLBP1P12271 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
RLBP1P12271 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
RLBP1P12271 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
RLBP1P12271 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
RLBP1P12271 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
RLBP1P12271 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
RLBP1P12271 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
RLBP1P12271 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
RLBP1P12271 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC30.48■■■□□ 2.47
RLBP1P12271 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
RLBP1P12271 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
RLBP1P12271 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
RLBP1P12271 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
RLBP1P12271 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
RLBP1P12271 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC30.48■■■□□ 2.47
RLBP1P12271 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
RLBP1P12271 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC30.47■■■□□ 2.47
RLBP1P12271 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
RLBP1P12271 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
RLBP1P12271 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
RLBP1P12271 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC30.47■■■□□ 2.47
RLBP1P12271 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
RLBP1P12271 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
RLBP1P12271 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
RLBP1P12271 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
RLBP1P12271 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC30.46■■■□□ 2.47
RLBP1P12271 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
RLBP1P12271 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
RLBP1P12271 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
RLBP1P12271 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
RLBP1P12271 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
RLBP1P12271 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
RLBP1P12271 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
RLBP1P12271 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
RLBP1P12271 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
RLBP1P12271 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
RLBP1P12271 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms