Protein–RNA interactions for Protein: P12270

TPR, Nucleoprotein TPR, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,363 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRP12270 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TPRP12270 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TPRP12270 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
TPRP12270 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TPRP12270 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TPRP12270 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TPRP12270 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TPRP12270 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TPRP12270 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TPRP12270 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
TPRP12270 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TPRP12270 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TPRP12270 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TPRP12270 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TPRP12270 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TPRP12270 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TPRP12270 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TPRP12270 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TPRP12270 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TPRP12270 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TPRP12270 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
TPRP12270 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TPRP12270 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TPRP12270 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TPRP12270 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
TPRP12270 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TPRP12270 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TPRP12270 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TPRP12270 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TPRP12270 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TPRP12270 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TPRP12270 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TPRP12270 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TPRP12270 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TPRP12270 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
TPRP12270 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TPRP12270 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TPRP12270 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TPRP12270 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TPRP12270 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
TPRP12270 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TPRP12270 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
TPRP12270 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TPRP12270 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TPRP12270 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TPRP12270 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TPRP12270 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TPRP12270 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
TPRP12270 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TPRP12270 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
TPRP12270 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TPRP12270 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TPRP12270 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TPRP12270 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
TPRP12270 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TPRP12270 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TPRP12270 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TPRP12270 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TPRP12270 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TPRP12270 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TPRP12270 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
TPRP12270 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TPRP12270 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TPRP12270 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TPRP12270 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TPRP12270 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TPRP12270 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TPRP12270 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
TPRP12270 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TPRP12270 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TPRP12270 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TPRP12270 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
TPRP12270 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TPRP12270 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TPRP12270 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TPRP12270 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
TPRP12270 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TPRP12270 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TPRP12270 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TPRP12270 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TPRP12270 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TPRP12270 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TPRP12270 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TPRP12270 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TPRP12270 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TPRP12270 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TPRP12270 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TPRP12270 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TPRP12270 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TPRP12270 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TPRP12270 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TPRP12270 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TPRP12270 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TPRP12270 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
TPRP12270 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TPRP12270 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TPRP12270 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TPRP12270 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TPRP12270 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TPRP12270 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms