Protein–RNA interactions for Protein: P11686

SFTPC, Pulmonary surfactant-associated protein C, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPCP11686 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SFTPCP11686 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SFTPCP11686 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SFTPCP11686 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SFTPCP11686 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SFTPCP11686 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SFTPCP11686 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SFTPCP11686 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SFTPCP11686 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SFTPCP11686 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SFTPCP11686 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SFTPCP11686 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SFTPCP11686 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SFTPCP11686 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SFTPCP11686 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SFTPCP11686 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SFTPCP11686 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SFTPCP11686 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SFTPCP11686 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SFTPCP11686 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SFTPCP11686 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SFTPCP11686 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SFTPCP11686 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SFTPCP11686 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SFTPCP11686 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SFTPCP11686 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SFTPCP11686 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SFTPCP11686 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SFTPCP11686 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SFTPCP11686 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SFTPCP11686 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SFTPCP11686 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SFTPCP11686 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SFTPCP11686 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SFTPCP11686 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SFTPCP11686 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SFTPCP11686 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SFTPCP11686 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SFTPCP11686 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SFTPCP11686 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SFTPCP11686 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SFTPCP11686 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SFTPCP11686 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SFTPCP11686 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SFTPCP11686 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SFTPCP11686 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SFTPCP11686 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SFTPCP11686 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SFTPCP11686 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SFTPCP11686 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SFTPCP11686 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SFTPCP11686 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SFTPCP11686 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SFTPCP11686 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SFTPCP11686 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SFTPCP11686 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SFTPCP11686 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SFTPCP11686 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SFTPCP11686 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SFTPCP11686 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SFTPCP11686 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SFTPCP11686 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SFTPCP11686 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SFTPCP11686 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SFTPCP11686 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SFTPCP11686 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SFTPCP11686 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SFTPCP11686 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SFTPCP11686 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SFTPCP11686 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SFTPCP11686 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SFTPCP11686 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SFTPCP11686 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SFTPCP11686 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SFTPCP11686 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SFTPCP11686 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SFTPCP11686 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SFTPCP11686 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SFTPCP11686 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SFTPCP11686 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SFTPCP11686 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SFTPCP11686 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SFTPCP11686 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SFTPCP11686 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SFTPCP11686 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SFTPCP11686 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SFTPCP11686 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SFTPCP11686 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SFTPCP11686 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SFTPCP11686 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SFTPCP11686 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SFTPCP11686 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SFTPCP11686 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SFTPCP11686 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SFTPCP11686 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SFTPCP11686 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SFTPCP11686 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SFTPCP11686 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SFTPCP11686 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SFTPCP11686 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 144.6 ms