Protein–RNA interactions for Protein: P0DMB2

C8orf88, Uncharacterized protein C8orf88, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf88P0DMB2 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
C8orf88P0DMB2 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
C8orf88P0DMB2 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
C8orf88P0DMB2 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
C8orf88P0DMB2 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
C8orf88P0DMB2 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
C8orf88P0DMB2 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
C8orf88P0DMB2 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
C8orf88P0DMB2 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
C8orf88P0DMB2 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
C8orf88P0DMB2 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
C8orf88P0DMB2 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
C8orf88P0DMB2 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
C8orf88P0DMB2 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
C8orf88P0DMB2 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
C8orf88P0DMB2 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
C8orf88P0DMB2 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
C8orf88P0DMB2 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
C8orf88P0DMB2 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
C8orf88P0DMB2 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
C8orf88P0DMB2 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
C8orf88P0DMB2 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
C8orf88P0DMB2 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
C8orf88P0DMB2 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
C8orf88P0DMB2 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
C8orf88P0DMB2 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
C8orf88P0DMB2 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
C8orf88P0DMB2 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
C8orf88P0DMB2 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
C8orf88P0DMB2 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
C8orf88P0DMB2 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
C8orf88P0DMB2 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
C8orf88P0DMB2 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
C8orf88P0DMB2 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
C8orf88P0DMB2 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
C8orf88P0DMB2 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
C8orf88P0DMB2 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
C8orf88P0DMB2 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
C8orf88P0DMB2 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
C8orf88P0DMB2 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
C8orf88P0DMB2 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
C8orf88P0DMB2 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
C8orf88P0DMB2 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
C8orf88P0DMB2 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
C8orf88P0DMB2 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
C8orf88P0DMB2 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
C8orf88P0DMB2 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
C8orf88P0DMB2 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
C8orf88P0DMB2 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
C8orf88P0DMB2 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
C8orf88P0DMB2 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
C8orf88P0DMB2 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
C8orf88P0DMB2 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
C8orf88P0DMB2 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
C8orf88P0DMB2 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
C8orf88P0DMB2 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
C8orf88P0DMB2 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
C8orf88P0DMB2 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
C8orf88P0DMB2 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
C8orf88P0DMB2 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
C8orf88P0DMB2 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
C8orf88P0DMB2 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
C8orf88P0DMB2 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
C8orf88P0DMB2 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
C8orf88P0DMB2 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
C8orf88P0DMB2 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
C8orf88P0DMB2 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
C8orf88P0DMB2 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
C8orf88P0DMB2 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
C8orf88P0DMB2 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
C8orf88P0DMB2 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
C8orf88P0DMB2 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
C8orf88P0DMB2 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
C8orf88P0DMB2 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
C8orf88P0DMB2 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
C8orf88P0DMB2 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
C8orf88P0DMB2 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
C8orf88P0DMB2 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
C8orf88P0DMB2 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
C8orf88P0DMB2 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
C8orf88P0DMB2 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
C8orf88P0DMB2 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
C8orf88P0DMB2 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
C8orf88P0DMB2 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
C8orf88P0DMB2 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
C8orf88P0DMB2 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
C8orf88P0DMB2 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.79■□□□□ 0.6
C8orf88P0DMB2 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
C8orf88P0DMB2 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
C8orf88P0DMB2 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
C8orf88P0DMB2 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
C8orf88P0DMB2 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
C8orf88P0DMB2 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
C8orf88P0DMB2 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
C8orf88P0DMB2 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
C8orf88P0DMB2 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
C8orf88P0DMB2 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
C8orf88P0DMB2 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
C8orf88P0DMB2 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
C8orf88P0DMB2 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms