Protein–RNA interactions for Protein: P0CG47

UBB, Polyubiquitin-B, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBBP0CG47 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
UBBP0CG47 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
UBBP0CG47 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
UBBP0CG47 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
UBBP0CG47 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
UBBP0CG47 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
UBBP0CG47 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
UBBP0CG47 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
UBBP0CG47 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
UBBP0CG47 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
UBBP0CG47 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
UBBP0CG47 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
UBBP0CG47 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
UBBP0CG47 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
UBBP0CG47 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
UBBP0CG47 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
UBBP0CG47 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
UBBP0CG47 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
UBBP0CG47 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
UBBP0CG47 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
UBBP0CG47 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
UBBP0CG47 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
UBBP0CG47 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
UBBP0CG47 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
UBBP0CG47 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
UBBP0CG47 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
UBBP0CG47 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
UBBP0CG47 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
UBBP0CG47 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
UBBP0CG47 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
UBBP0CG47 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
UBBP0CG47 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
UBBP0CG47 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
UBBP0CG47 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
UBBP0CG47 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
UBBP0CG47 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
UBBP0CG47 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
UBBP0CG47 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
UBBP0CG47 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
UBBP0CG47 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
UBBP0CG47 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
UBBP0CG47 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
UBBP0CG47 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
UBBP0CG47 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
UBBP0CG47 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
UBBP0CG47 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
UBBP0CG47 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
UBBP0CG47 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
UBBP0CG47 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
UBBP0CG47 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
UBBP0CG47 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
UBBP0CG47 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
UBBP0CG47 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
UBBP0CG47 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
UBBP0CG47 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
UBBP0CG47 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
UBBP0CG47 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
UBBP0CG47 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
UBBP0CG47 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
UBBP0CG47 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
UBBP0CG47 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
UBBP0CG47 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
UBBP0CG47 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
UBBP0CG47 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
UBBP0CG47 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
UBBP0CG47 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
UBBP0CG47 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
UBBP0CG47 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
UBBP0CG47 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
UBBP0CG47 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
UBBP0CG47 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
UBBP0CG47 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
UBBP0CG47 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
UBBP0CG47 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
UBBP0CG47 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
UBBP0CG47 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
UBBP0CG47 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
UBBP0CG47 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
UBBP0CG47 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
UBBP0CG47 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
UBBP0CG47 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
UBBP0CG47 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
UBBP0CG47 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
UBBP0CG47 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
UBBP0CG47 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
UBBP0CG47 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
UBBP0CG47 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
UBBP0CG47 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
UBBP0CG47 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
UBBP0CG47 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
UBBP0CG47 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
UBBP0CG47 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
UBBP0CG47 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
UBBP0CG47 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
UBBP0CG47 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
UBBP0CG47 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
UBBP0CG47 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
UBBP0CG47 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
UBBP0CG47 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
UBBP0CG47 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms