Protein–RNA interactions for Protein: P09669

COX6C, Cytochrome c oxidase subunit 6C, humanhuman

Predictions only

Length 75 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX6CP09669 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
COX6CP09669 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
COX6CP09669 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
COX6CP09669 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
COX6CP09669 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
COX6CP09669 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
COX6CP09669 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
COX6CP09669 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
COX6CP09669 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
COX6CP09669 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
COX6CP09669 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
COX6CP09669 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
COX6CP09669 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
COX6CP09669 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
COX6CP09669 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
COX6CP09669 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
COX6CP09669 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
COX6CP09669 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
COX6CP09669 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
COX6CP09669 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
COX6CP09669 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
COX6CP09669 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
COX6CP09669 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
COX6CP09669 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
COX6CP09669 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
COX6CP09669 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
COX6CP09669 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
COX6CP09669 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
COX6CP09669 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
COX6CP09669 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
COX6CP09669 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
COX6CP09669 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
COX6CP09669 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
COX6CP09669 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
COX6CP09669 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
COX6CP09669 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
COX6CP09669 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
COX6CP09669 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
COX6CP09669 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
COX6CP09669 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
COX6CP09669 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
COX6CP09669 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
COX6CP09669 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
COX6CP09669 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
COX6CP09669 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
COX6CP09669 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
COX6CP09669 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
COX6CP09669 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
COX6CP09669 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COX6CP09669 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COX6CP09669 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COX6CP09669 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COX6CP09669 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COX6CP09669 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
COX6CP09669 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
COX6CP09669 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
COX6CP09669 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
COX6CP09669 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
COX6CP09669 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
COX6CP09669 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
COX6CP09669 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
COX6CP09669 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
COX6CP09669 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
COX6CP09669 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
COX6CP09669 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
COX6CP09669 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
COX6CP09669 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
COX6CP09669 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
COX6CP09669 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
COX6CP09669 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
COX6CP09669 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
COX6CP09669 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
COX6CP09669 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
COX6CP09669 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
COX6CP09669 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
COX6CP09669 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
COX6CP09669 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
COX6CP09669 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
COX6CP09669 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
COX6CP09669 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
COX6CP09669 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
COX6CP09669 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
COX6CP09669 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
COX6CP09669 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
COX6CP09669 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
COX6CP09669 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
COX6CP09669 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
COX6CP09669 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
COX6CP09669 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COX6CP09669 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COX6CP09669 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COX6CP09669 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COX6CP09669 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COX6CP09669 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COX6CP09669 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
COX6CP09669 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
COX6CP09669 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
COX6CP09669 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COX6CP09669 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COX6CP09669 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.7 ms