Protein–RNA interactions for Protein: O95727

CRTAM, Cytotoxic and regulatory T-cell molecule, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRTAMO95727 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CRTAMO95727 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CRTAMO95727 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CRTAMO95727 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CRTAMO95727 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CRTAMO95727 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CRTAMO95727 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CRTAMO95727 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CRTAMO95727 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CRTAMO95727 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CRTAMO95727 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CRTAMO95727 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CRTAMO95727 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CRTAMO95727 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CRTAMO95727 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CRTAMO95727 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CRTAMO95727 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CRTAMO95727 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CRTAMO95727 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CRTAMO95727 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CRTAMO95727 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CRTAMO95727 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CRTAMO95727 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CRTAMO95727 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CRTAMO95727 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CRTAMO95727 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CRTAMO95727 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CRTAMO95727 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CRTAMO95727 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CRTAMO95727 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CRTAMO95727 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CRTAMO95727 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CRTAMO95727 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CRTAMO95727 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CRTAMO95727 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CRTAMO95727 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CRTAMO95727 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CRTAMO95727 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CRTAMO95727 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CRTAMO95727 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CRTAMO95727 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CRTAMO95727 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CRTAMO95727 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CRTAMO95727 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CRTAMO95727 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CRTAMO95727 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CRTAMO95727 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CRTAMO95727 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CRTAMO95727 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CRTAMO95727 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CRTAMO95727 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CRTAMO95727 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CRTAMO95727 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CRTAMO95727 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CRTAMO95727 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CRTAMO95727 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CRTAMO95727 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CRTAMO95727 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CRTAMO95727 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CRTAMO95727 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CRTAMO95727 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CRTAMO95727 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CRTAMO95727 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CRTAMO95727 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CRTAMO95727 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CRTAMO95727 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CRTAMO95727 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CRTAMO95727 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CRTAMO95727 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CRTAMO95727 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CRTAMO95727 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CRTAMO95727 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CRTAMO95727 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CRTAMO95727 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CRTAMO95727 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CRTAMO95727 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CRTAMO95727 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CRTAMO95727 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CRTAMO95727 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CRTAMO95727 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CRTAMO95727 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CRTAMO95727 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CRTAMO95727 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CRTAMO95727 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CRTAMO95727 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CRTAMO95727 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CRTAMO95727 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CRTAMO95727 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CRTAMO95727 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CRTAMO95727 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CRTAMO95727 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CRTAMO95727 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CRTAMO95727 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CRTAMO95727 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CRTAMO95727 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CRTAMO95727 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CRTAMO95727 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CRTAMO95727 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CRTAMO95727 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CRTAMO95727 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms