Protein–RNA interactions for Protein: O95166

GABARAP, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPO95166 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GABARAPO95166 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GABARAPO95166 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GABARAPO95166 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GABARAPO95166 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GABARAPO95166 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GABARAPO95166 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GABARAPO95166 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GABARAPO95166 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GABARAPO95166 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GABARAPO95166 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GABARAPO95166 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GABARAPO95166 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GABARAPO95166 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GABARAPO95166 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GABARAPO95166 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GABARAPO95166 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GABARAPO95166 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GABARAPO95166 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GABARAPO95166 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GABARAPO95166 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GABARAPO95166 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GABARAPO95166 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GABARAPO95166 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GABARAPO95166 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GABARAPO95166 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GABARAPO95166 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GABARAPO95166 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GABARAPO95166 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GABARAPO95166 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GABARAPO95166 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GABARAPO95166 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
GABARAPO95166 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GABARAPO95166 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GABARAPO95166 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GABARAPO95166 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GABARAPO95166 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GABARAPO95166 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GABARAPO95166 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GABARAPO95166 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GABARAPO95166 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GABARAPO95166 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GABARAPO95166 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GABARAPO95166 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GABARAPO95166 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GABARAPO95166 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GABARAPO95166 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GABARAPO95166 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GABARAPO95166 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GABARAPO95166 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GABARAPO95166 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GABARAPO95166 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GABARAPO95166 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GABARAPO95166 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GABARAPO95166 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GABARAPO95166 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GABARAPO95166 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GABARAPO95166 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GABARAPO95166 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GABARAPO95166 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GABARAPO95166 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GABARAPO95166 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GABARAPO95166 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GABARAPO95166 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GABARAPO95166 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GABARAPO95166 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GABARAPO95166 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GABARAPO95166 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GABARAPO95166 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GABARAPO95166 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GABARAPO95166 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
GABARAPO95166 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GABARAPO95166 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GABARAPO95166 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GABARAPO95166 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GABARAPO95166 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GABARAPO95166 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GABARAPO95166 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GABARAPO95166 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GABARAPO95166 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GABARAPO95166 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GABARAPO95166 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GABARAPO95166 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GABARAPO95166 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GABARAPO95166 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GABARAPO95166 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GABARAPO95166 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GABARAPO95166 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GABARAPO95166 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
GABARAPO95166 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GABARAPO95166 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GABARAPO95166 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GABARAPO95166 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GABARAPO95166 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GABARAPO95166 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GABARAPO95166 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GABARAPO95166 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GABARAPO95166 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GABARAPO95166 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GABARAPO95166 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.6 ms