Protein–RNA interactions for Protein: O95149

SNUPN, Snurportin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNUPNO95149 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SNUPNO95149 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SNUPNO95149 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SNUPNO95149 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNUPNO95149 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNUPNO95149 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNUPNO95149 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNUPNO95149 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNUPNO95149 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SNUPNO95149 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SNUPNO95149 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SNUPNO95149 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SNUPNO95149 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SNUPNO95149 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SNUPNO95149 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SNUPNO95149 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SNUPNO95149 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SNUPNO95149 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNUPNO95149 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNUPNO95149 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SNUPNO95149 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SNUPNO95149 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SNUPNO95149 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SNUPNO95149 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SNUPNO95149 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SNUPNO95149 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SNUPNO95149 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SNUPNO95149 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SNUPNO95149 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SNUPNO95149 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SNUPNO95149 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SNUPNO95149 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SNUPNO95149 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SNUPNO95149 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SNUPNO95149 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SNUPNO95149 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SNUPNO95149 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNUPNO95149 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SNUPNO95149 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNUPNO95149 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNUPNO95149 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNUPNO95149 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNUPNO95149 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNUPNO95149 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNUPNO95149 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNUPNO95149 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNUPNO95149 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNUPNO95149 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNUPNO95149 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNUPNO95149 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNUPNO95149 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNUPNO95149 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNUPNO95149 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNUPNO95149 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNUPNO95149 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNUPNO95149 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNUPNO95149 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SNUPNO95149 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNUPNO95149 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNUPNO95149 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNUPNO95149 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNUPNO95149 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SNUPNO95149 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SNUPNO95149 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SNUPNO95149 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SNUPNO95149 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SNUPNO95149 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SNUPNO95149 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SNUPNO95149 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SNUPNO95149 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SNUPNO95149 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SNUPNO95149 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SNUPNO95149 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNUPNO95149 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNUPNO95149 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNUPNO95149 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNUPNO95149 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNUPNO95149 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNUPNO95149 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNUPNO95149 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNUPNO95149 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNUPNO95149 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SNUPNO95149 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNUPNO95149 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNUPNO95149 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNUPNO95149 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SNUPNO95149 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SNUPNO95149 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SNUPNO95149 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SNUPNO95149 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SNUPNO95149 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SNUPNO95149 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SNUPNO95149 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SNUPNO95149 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SNUPNO95149 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SNUPNO95149 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SNUPNO95149 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SNUPNO95149 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SNUPNO95149 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNUPNO95149 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.9 ms