Protein–RNA interactions for Protein: O94806

PRKD3, Serine/threonine-protein kinase D3, humanhuman

Predictions only

Length 890 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKD3O94806 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRKD3O94806 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRKD3O94806 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRKD3O94806 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRKD3O94806 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRKD3O94806 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRKD3O94806 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRKD3O94806 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRKD3O94806 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRKD3O94806 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRKD3O94806 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRKD3O94806 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRKD3O94806 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRKD3O94806 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRKD3O94806 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRKD3O94806 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRKD3O94806 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRKD3O94806 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRKD3O94806 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRKD3O94806 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRKD3O94806 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRKD3O94806 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRKD3O94806 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRKD3O94806 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRKD3O94806 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRKD3O94806 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRKD3O94806 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRKD3O94806 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRKD3O94806 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRKD3O94806 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRKD3O94806 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRKD3O94806 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRKD3O94806 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRKD3O94806 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRKD3O94806 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRKD3O94806 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PRKD3O94806 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRKD3O94806 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRKD3O94806 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRKD3O94806 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRKD3O94806 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRKD3O94806 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRKD3O94806 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRKD3O94806 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRKD3O94806 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRKD3O94806 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRKD3O94806 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRKD3O94806 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRKD3O94806 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRKD3O94806 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRKD3O94806 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRKD3O94806 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRKD3O94806 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRKD3O94806 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRKD3O94806 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRKD3O94806 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRKD3O94806 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRKD3O94806 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRKD3O94806 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRKD3O94806 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRKD3O94806 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRKD3O94806 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRKD3O94806 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRKD3O94806 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRKD3O94806 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRKD3O94806 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRKD3O94806 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRKD3O94806 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRKD3O94806 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRKD3O94806 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRKD3O94806 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRKD3O94806 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRKD3O94806 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRKD3O94806 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRKD3O94806 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRKD3O94806 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRKD3O94806 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRKD3O94806 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRKD3O94806 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRKD3O94806 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRKD3O94806 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRKD3O94806 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRKD3O94806 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRKD3O94806 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRKD3O94806 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRKD3O94806 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PRKD3O94806 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRKD3O94806 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRKD3O94806 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRKD3O94806 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRKD3O94806 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRKD3O94806 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRKD3O94806 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRKD3O94806 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRKD3O94806 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRKD3O94806 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRKD3O94806 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRKD3O94806 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRKD3O94806 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRKD3O94806 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms