Protein–RNA interactions for Protein: O75783

RHBDL1, Rhomboid-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDL1O75783 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RHBDL1O75783 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RHBDL1O75783 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RHBDL1O75783 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RHBDL1O75783 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RHBDL1O75783 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RHBDL1O75783 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RHBDL1O75783 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RHBDL1O75783 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RHBDL1O75783 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
RHBDL1O75783 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RHBDL1O75783 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RHBDL1O75783 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RHBDL1O75783 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
RHBDL1O75783 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RHBDL1O75783 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RHBDL1O75783 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RHBDL1O75783 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RHBDL1O75783 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RHBDL1O75783 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RHBDL1O75783 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RHBDL1O75783 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
RHBDL1O75783 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RHBDL1O75783 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RHBDL1O75783 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RHBDL1O75783 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RHBDL1O75783 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RHBDL1O75783 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RHBDL1O75783 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RHBDL1O75783 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RHBDL1O75783 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RHBDL1O75783 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RHBDL1O75783 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RHBDL1O75783 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RHBDL1O75783 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RHBDL1O75783 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RHBDL1O75783 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RHBDL1O75783 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RHBDL1O75783 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RHBDL1O75783 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RHBDL1O75783 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RHBDL1O75783 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RHBDL1O75783 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RHBDL1O75783 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RHBDL1O75783 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RHBDL1O75783 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RHBDL1O75783 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RHBDL1O75783 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RHBDL1O75783 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
RHBDL1O75783 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RHBDL1O75783 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RHBDL1O75783 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RHBDL1O75783 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RHBDL1O75783 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RHBDL1O75783 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RHBDL1O75783 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RHBDL1O75783 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RHBDL1O75783 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
RHBDL1O75783 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
RHBDL1O75783 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RHBDL1O75783 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RHBDL1O75783 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RHBDL1O75783 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RHBDL1O75783 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RHBDL1O75783 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
RHBDL1O75783 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RHBDL1O75783 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RHBDL1O75783 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RHBDL1O75783 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
RHBDL1O75783 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RHBDL1O75783 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RHBDL1O75783 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RHBDL1O75783 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RHBDL1O75783 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RHBDL1O75783 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RHBDL1O75783 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RHBDL1O75783 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RHBDL1O75783 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RHBDL1O75783 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RHBDL1O75783 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RHBDL1O75783 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RHBDL1O75783 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
RHBDL1O75783 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RHBDL1O75783 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RHBDL1O75783 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RHBDL1O75783 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RHBDL1O75783 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RHBDL1O75783 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
RHBDL1O75783 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RHBDL1O75783 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RHBDL1O75783 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RHBDL1O75783 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RHBDL1O75783 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RHBDL1O75783 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RHBDL1O75783 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RHBDL1O75783 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RHBDL1O75783 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RHBDL1O75783 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RHBDL1O75783 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
RHBDL1O75783 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms