Protein–RNA interactions for Protein: O60811

PRAMEF2, PRAME family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF2O60811 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRAMEF2O60811 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRAMEF2O60811 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRAMEF2O60811 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRAMEF2O60811 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRAMEF2O60811 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRAMEF2O60811 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRAMEF2O60811 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PRAMEF2O60811 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRAMEF2O60811 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRAMEF2O60811 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRAMEF2O60811 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRAMEF2O60811 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PRAMEF2O60811 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRAMEF2O60811 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRAMEF2O60811 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRAMEF2O60811 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRAMEF2O60811 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRAMEF2O60811 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRAMEF2O60811 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRAMEF2O60811 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRAMEF2O60811 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRAMEF2O60811 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRAMEF2O60811 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRAMEF2O60811 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRAMEF2O60811 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRAMEF2O60811 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRAMEF2O60811 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRAMEF2O60811 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRAMEF2O60811 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRAMEF2O60811 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRAMEF2O60811 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRAMEF2O60811 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRAMEF2O60811 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRAMEF2O60811 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.52■■□□□ 1.19
PRAMEF2O60811 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.19
PRAMEF2O60811 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRAMEF2O60811 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRAMEF2O60811 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRAMEF2O60811 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRAMEF2O60811 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRAMEF2O60811 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRAMEF2O60811 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRAMEF2O60811 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRAMEF2O60811 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRAMEF2O60811 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PRAMEF2O60811 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PRAMEF2O60811 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRAMEF2O60811 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PRAMEF2O60811 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRAMEF2O60811 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRAMEF2O60811 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRAMEF2O60811 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PRAMEF2O60811 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PRAMEF2O60811 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRAMEF2O60811 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRAMEF2O60811 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRAMEF2O60811 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRAMEF2O60811 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRAMEF2O60811 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRAMEF2O60811 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRAMEF2O60811 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PRAMEF2O60811 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRAMEF2O60811 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRAMEF2O60811 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRAMEF2O60811 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PRAMEF2O60811 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRAMEF2O60811 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRAMEF2O60811 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRAMEF2O60811 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRAMEF2O60811 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRAMEF2O60811 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRAMEF2O60811 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PRAMEF2O60811 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PRAMEF2O60811 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PRAMEF2O60811 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRAMEF2O60811 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRAMEF2O60811 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRAMEF2O60811 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRAMEF2O60811 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRAMEF2O60811 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRAMEF2O60811 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRAMEF2O60811 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRAMEF2O60811 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRAMEF2O60811 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRAMEF2O60811 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRAMEF2O60811 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRAMEF2O60811 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRAMEF2O60811 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRAMEF2O60811 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRAMEF2O60811 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRAMEF2O60811 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRAMEF2O60811 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRAMEF2O60811 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRAMEF2O60811 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRAMEF2O60811 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRAMEF2O60811 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRAMEF2O60811 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRAMEF2O60811 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRAMEF2O60811 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.2 ms