Protein–RNA interactions for Protein: O60308

CEP104, Centrosomal protein of 104 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP104O60308 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CEP104O60308 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CEP104O60308 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CEP104O60308 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CEP104O60308 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CEP104O60308 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CEP104O60308 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CEP104O60308 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CEP104O60308 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CEP104O60308 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CEP104O60308 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CEP104O60308 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CEP104O60308 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CEP104O60308 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CEP104O60308 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CEP104O60308 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CEP104O60308 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CEP104O60308 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CEP104O60308 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CEP104O60308 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CEP104O60308 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CEP104O60308 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CEP104O60308 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CEP104O60308 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CEP104O60308 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CEP104O60308 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CEP104O60308 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CEP104O60308 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CEP104O60308 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CEP104O60308 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CEP104O60308 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CEP104O60308 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CEP104O60308 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CEP104O60308 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CEP104O60308 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CEP104O60308 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CEP104O60308 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CEP104O60308 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CEP104O60308 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CEP104O60308 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CEP104O60308 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CEP104O60308 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CEP104O60308 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CEP104O60308 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CEP104O60308 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CEP104O60308 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CEP104O60308 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CEP104O60308 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CEP104O60308 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CEP104O60308 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CEP104O60308 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CEP104O60308 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CEP104O60308 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CEP104O60308 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CEP104O60308 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CEP104O60308 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CEP104O60308 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CEP104O60308 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CEP104O60308 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CEP104O60308 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CEP104O60308 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CEP104O60308 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CEP104O60308 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CEP104O60308 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CEP104O60308 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CEP104O60308 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CEP104O60308 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CEP104O60308 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CEP104O60308 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CEP104O60308 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CEP104O60308 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CEP104O60308 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CEP104O60308 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CEP104O60308 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CEP104O60308 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CEP104O60308 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CEP104O60308 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CEP104O60308 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CEP104O60308 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CEP104O60308 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CEP104O60308 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CEP104O60308 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CEP104O60308 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CEP104O60308 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CEP104O60308 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CEP104O60308 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CEP104O60308 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CEP104O60308 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CEP104O60308 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CEP104O60308 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CEP104O60308 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CEP104O60308 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CEP104O60308 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CEP104O60308 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CEP104O60308 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CEP104O60308 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CEP104O60308 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CEP104O60308 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CEP104O60308 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CEP104O60308 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms