Protein–RNA interactions for Protein: O60296

TRAK2, Trafficking kinesin-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAK2O60296 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TRAK2O60296 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TRAK2O60296 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TRAK2O60296 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TRAK2O60296 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TRAK2O60296 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TRAK2O60296 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TRAK2O60296 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
TRAK2O60296 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TRAK2O60296 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TRAK2O60296 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TRAK2O60296 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TRAK2O60296 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
TRAK2O60296 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
TRAK2O60296 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
TRAK2O60296 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
TRAK2O60296 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
TRAK2O60296 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
TRAK2O60296 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
TRAK2O60296 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
TRAK2O60296 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
TRAK2O60296 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TRAK2O60296 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TRAK2O60296 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TRAK2O60296 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TRAK2O60296 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TRAK2O60296 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TRAK2O60296 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TRAK2O60296 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
TRAK2O60296 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TRAK2O60296 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TRAK2O60296 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TRAK2O60296 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TRAK2O60296 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TRAK2O60296 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TRAK2O60296 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TRAK2O60296 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TRAK2O60296 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TRAK2O60296 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TRAK2O60296 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
TRAK2O60296 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TRAK2O60296 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TRAK2O60296 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TRAK2O60296 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TRAK2O60296 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TRAK2O60296 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TRAK2O60296 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TRAK2O60296 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TRAK2O60296 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TRAK2O60296 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TRAK2O60296 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TRAK2O60296 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TRAK2O60296 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TRAK2O60296 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TRAK2O60296 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TRAK2O60296 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TRAK2O60296 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TRAK2O60296 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TRAK2O60296 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TRAK2O60296 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TRAK2O60296 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TRAK2O60296 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TRAK2O60296 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TRAK2O60296 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TRAK2O60296 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
TRAK2O60296 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TRAK2O60296 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TRAK2O60296 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TRAK2O60296 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TRAK2O60296 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TRAK2O60296 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TRAK2O60296 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TRAK2O60296 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TRAK2O60296 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TRAK2O60296 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TRAK2O60296 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TRAK2O60296 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TRAK2O60296 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TRAK2O60296 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TRAK2O60296 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TRAK2O60296 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TRAK2O60296 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TRAK2O60296 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TRAK2O60296 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TRAK2O60296 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TRAK2O60296 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TRAK2O60296 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TRAK2O60296 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TRAK2O60296 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TRAK2O60296 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
TRAK2O60296 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TRAK2O60296 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TRAK2O60296 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TRAK2O60296 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TRAK2O60296 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TRAK2O60296 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TRAK2O60296 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TRAK2O60296 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TRAK2O60296 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TRAK2O60296 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms